More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2470 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  100 
 
 
322 aa  619  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  75 
 
 
309 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  75.5 
 
 
308 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  75.5 
 
 
308 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  57.1 
 
 
324 aa  346  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  57.01 
 
 
327 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  59.02 
 
 
307 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  59.48 
 
 
311 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  52.45 
 
 
326 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  57.28 
 
 
328 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  58.5 
 
 
311 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  55.23 
 
 
331 aa  334  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  56.45 
 
 
328 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  53.95 
 
 
325 aa  325  7e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  57.89 
 
 
318 aa  316  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  55.05 
 
 
308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  53.82 
 
 
306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  53.49 
 
 
306 aa  302  5.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  55.81 
 
 
309 aa  302  6.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  54.61 
 
 
310 aa  299  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  55.7 
 
 
308 aa  298  7e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  53.31 
 
 
306 aa  298  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  55.56 
 
 
308 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  55.7 
 
 
308 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  54.79 
 
 
309 aa  296  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  54.61 
 
 
306 aa  294  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  53.49 
 
 
309 aa  292  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  57.84 
 
 
308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  49.67 
 
 
309 aa  280  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  47.92 
 
 
321 aa  269  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  50.33 
 
 
306 aa  265  8e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  50.33 
 
 
306 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  48.84 
 
 
307 aa  263  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  47.23 
 
 
306 aa  259  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  49.38 
 
 
341 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  49.19 
 
 
319 aa  257  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  47.77 
 
 
321 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  48.68 
 
 
310 aa  256  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  48.2 
 
 
305 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  48.2 
 
 
304 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  49.5 
 
 
311 aa  251  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  45.7 
 
 
304 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  46.36 
 
 
302 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  48.53 
 
 
306 aa  245  6.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  47.23 
 
 
307 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  48.41 
 
 
282 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  44.74 
 
 
298 aa  233  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  43.85 
 
 
299 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  43.05 
 
 
315 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  45.39 
 
 
298 aa  227  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  45.82 
 
 
296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  44.82 
 
 
307 aa  225  7e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  40.26 
 
 
299 aa  225  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  39.47 
 
 
300 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  44.01 
 
 
303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  43.23 
 
 
302 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  43.42 
 
 
298 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  41.64 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  44.55 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  43.28 
 
 
299 aa  209  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  38.33 
 
 
297 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  38.33 
 
 
297 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  38.33 
 
 
297 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  38.33 
 
 
297 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  34.97 
 
 
302 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  34.97 
 
 
302 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  38.94 
 
 
297 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  38.94 
 
 
297 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  38.94 
 
 
297 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  43.17 
 
 
306 aa  206  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  38.61 
 
 
297 aa  206  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  38.61 
 
 
297 aa  206  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  38.94 
 
 
297 aa  205  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  37 
 
 
297 aa  202  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  41.64 
 
 
301 aa  202  8e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  41.23 
 
 
302 aa  196  5.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  39.02 
 
 
301 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  37.67 
 
 
297 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  37.5 
 
 
351 aa  185  9e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  37.46 
 
 
301 aa  162  5.0000000000000005e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  33.22 
 
 
317 aa  160  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  33.01 
 
 
398 aa  156  4e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  35.48 
 
 
324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.71 
 
 
309 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  33.33 
 
 
309 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  36.92 
 
 
301 aa  127  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.03 
 
 
309 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  37.62 
 
 
315 aa  122  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.35 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  32.99 
 
 
306 aa  119  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.99 
 
 
315 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.1 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  28.02 
 
 
314 aa  98.6  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.61 
 
 
319 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0277  agmatinase  29.14 
 
 
322 aa  90.1  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.17372 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2645  formimidoylglutamase  32.89 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2879  formimidoylglutamase  30.54 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1296  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.83 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.925134 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2473  formimidoylglutamase  30.54 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1926  Arginase/agmatinase/formimino glutamase  30 
 
 
295 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>