More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4596 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4596  arginase  100 
 
 
315 aa  644    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  54.82 
 
 
298 aa  325  5e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  53.97 
 
 
299 aa  318  6e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  52.98 
 
 
299 aa  311  9e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  52 
 
 
301 aa  310  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  51.48 
 
 
300 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  52.79 
 
 
302 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  52.48 
 
 
301 aa  307  1.0000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  51.32 
 
 
299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  52 
 
 
297 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  52 
 
 
297 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  51.67 
 
 
297 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  52 
 
 
297 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  52 
 
 
297 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  52 
 
 
297 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  51.67 
 
 
297 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  51.67 
 
 
297 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  51.85 
 
 
297 aa  299  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  51 
 
 
297 aa  297  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  51 
 
 
297 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  51 
 
 
297 aa  297  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  49.67 
 
 
302 aa  292  4e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  51.67 
 
 
306 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  48.06 
 
 
306 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  49.5 
 
 
308 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  49.83 
 
 
298 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  48.68 
 
 
299 aa  277  1e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  48.68 
 
 
303 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  48.18 
 
 
296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  46.88 
 
 
351 aa  271  1e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  48.86 
 
 
298 aa  264  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  46.43 
 
 
307 aa  263  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  46.18 
 
 
306 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  46.03 
 
 
304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  46.84 
 
 
310 aa  259  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  45.9 
 
 
321 aa  258  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  45.85 
 
 
306 aa  257  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  46.67 
 
 
321 aa  256  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  46.36 
 
 
319 aa  255  9e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  46.2 
 
 
305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  42.67 
 
 
311 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  42.67 
 
 
311 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  45.82 
 
 
307 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  46.15 
 
 
307 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  45.02 
 
 
341 aa  246  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  44.52 
 
 
302 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  44.33 
 
 
306 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  41.1 
 
 
302 aa  239  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  41.1 
 
 
302 aa  239  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  41.83 
 
 
307 aa  238  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  46.62 
 
 
282 aa  235  9e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  42.19 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  44.15 
 
 
311 aa  232  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  44.77 
 
 
324 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  43.09 
 
 
326 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  43.05 
 
 
322 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  42.9 
 
 
327 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  41.51 
 
 
328 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  44.92 
 
 
309 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  42.09 
 
 
328 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  40.98 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  42.57 
 
 
318 aa  219  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  41.1 
 
 
309 aa  219  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  41.64 
 
 
331 aa  217  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  39.67 
 
 
308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  40.85 
 
 
308 aa  216  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  39.4 
 
 
310 aa  216  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  40.85 
 
 
308 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  40.72 
 
 
309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  38.94 
 
 
306 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  38.61 
 
 
306 aa  209  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  39.02 
 
 
309 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  38.33 
 
 
309 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  40 
 
 
308 aa  203  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  37.17 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  43.23 
 
 
308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  43.28 
 
 
308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  43.28 
 
 
308 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  42.42 
 
 
306 aa  199  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  40.33 
 
 
301 aa  189  4e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  35.65 
 
 
324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  34.23 
 
 
398 aa  181  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  38.23 
 
 
309 aa  178  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38.72 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  33.54 
 
 
317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.91 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  36.43 
 
 
306 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.86 
 
 
315 aa  149  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.41 
 
 
309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.12 
 
 
309 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.34 
 
 
315 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  38.57 
 
 
301 aa  143  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  29.03 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.81 
 
 
335 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  27.8 
 
 
356 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1296  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.15 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.925134 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  28.38 
 
 
351 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  29.11 
 
 
331 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0861741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3224  agmatinase  29.13 
 
 
333 aa  92.8  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>