More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0238 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0238  arginase  100 
 
 
306 aa  623  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  84.77 
 
 
307 aa  531  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  71.19 
 
 
321 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  71.91 
 
 
311 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  71.1 
 
 
310 aa  430  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  68.56 
 
 
305 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  67.22 
 
 
304 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  70.11 
 
 
282 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  67.99 
 
 
341 aa  408  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  63.55 
 
 
304 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  62.91 
 
 
306 aa  394  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  64.88 
 
 
302 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  62.58 
 
 
306 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  66.56 
 
 
319 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  62.33 
 
 
307 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  60.6 
 
 
321 aa  357  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  48.21 
 
 
309 aa  271  9e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  47.74 
 
 
308 aa  269  5e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  47.74 
 
 
308 aa  268  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  47.59 
 
 
311 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  50.17 
 
 
310 aa  265  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  47.27 
 
 
311 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  47.37 
 
 
307 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  46.79 
 
 
324 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  47.04 
 
 
325 aa  260  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  45.33 
 
 
298 aa  259  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  47.27 
 
 
331 aa  257  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  47.06 
 
 
328 aa  255  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  45.28 
 
 
306 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  48 
 
 
318 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  47.04 
 
 
327 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  46.86 
 
 
328 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  46.41 
 
 
322 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  44.95 
 
 
306 aa  249  4e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  45.93 
 
 
306 aa  248  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  45.22 
 
 
326 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  45.36 
 
 
302 aa  246  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  45.82 
 
 
299 aa  245  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  46.89 
 
 
309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  46.15 
 
 
299 aa  242  6e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  46.53 
 
 
309 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  44.33 
 
 
315 aa  240  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  45.87 
 
 
309 aa  240  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  43.42 
 
 
301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  43.89 
 
 
298 aa  238  6.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  43.38 
 
 
300 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  43.43 
 
 
303 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  46.73 
 
 
308 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  43.38 
 
 
299 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  46.49 
 
 
308 aa  235  7e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  43.28 
 
 
299 aa  235  8e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  44.97 
 
 
296 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  44.33 
 
 
308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  43.09 
 
 
298 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  43.19 
 
 
297 aa  231  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  43.52 
 
 
306 aa  229  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  40.34 
 
 
297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  40.34 
 
 
297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  40.68 
 
 
297 aa  219  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  40.34 
 
 
297 aa  219  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  43.85 
 
 
309 aa  219  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  40.34 
 
 
297 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  40.34 
 
 
297 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  37.34 
 
 
302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  37.34 
 
 
302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  42.86 
 
 
301 aa  216  4e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  40 
 
 
297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  40 
 
 
297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  44.95 
 
 
306 aa  215  9e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  40 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  40 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  39.66 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  45.03 
 
 
308 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  40 
 
 
302 aa  207  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  44.7 
 
 
308 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  43.42 
 
 
308 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  40.32 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  40.2 
 
 
307 aa  199  7e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  37.24 
 
 
351 aa  196  5.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  39.06 
 
 
301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  39.08 
 
 
324 aa  169  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  33.72 
 
 
398 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  32.77 
 
 
317 aa  154  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.45 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.46 
 
 
315 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.81 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  32.31 
 
 
309 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.35 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  36.96 
 
 
301 aa  136  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.65 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.31 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  31.21 
 
 
306 aa  128  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  29.45 
 
 
314 aa  122  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.28 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.91 
 
 
335 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1784  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.92 
 
 
334 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  32.57 
 
 
356 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0743  agmatinase  28.09 
 
 
401 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618135  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  27.61 
 
 
396 aa  90.5  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40880  agmatinase  26.25 
 
 
416 aa  90.5  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>