More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3884 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3884  arginase  100 
 
 		 321 aa  655    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  77.67 
 
 		 310 aa  488  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  77.67 
 
 		 311 aa  478  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  73.24 
 
 		 304 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  76.95 
 
 		 282 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  71.52 
 
 		 305 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  71.19 
 
 		 306 aa  443  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  70.57 
 
 		 307 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  68.4 
 
 		 341 aa  418  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  66.67 
 
 		 304 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  66.56 
 
 		 306 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  66.22 
 
 		 302 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  66.23 
 
 		 306 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  66.56 
 
 		 319 aa  412  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  64.67 
 
 		 307 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  62.58 
 
 		 321 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  49.35 
 
 		 308 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  49.35 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  48.52 
 
 		 307 aa  272  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  47.85 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  48.21 
 
 		 311 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  48.38 
 
 		 311 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  46.67 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  49.34 
 
 		 318 aa  256  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  49.5 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  46.82 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  45.33 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  46.96 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  43.67 
 
 		 299 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  46.35 
 
 		 326 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  43.96 
 
 		 301 aa  248  9e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  44.85 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  43.38 
 
 		 300 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  45.86 
 
 		 328 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  44.15 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  39.4 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  39.4 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  46 
 
 		 299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  46.08 
 
 		 306 aa  243  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  45.6 
 
 		 306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  45.75 
 
 		 306 aa  242  7e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  44.59 
 
 		 325 aa  241  9e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  46.58 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  45.57 
 
 		 309 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  42.37 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  44.94 
 
 		 328 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  46.03 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  44.41 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  42.23 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  44.88 
 
 		 327 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  41.89 
 
 		 297 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  44.44 
 
 		 303 aa  235  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  46.51 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  41.89 
 
 		 297 aa  235  6e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  44.15 
 
 		 299 aa  235  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  41.89 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  41.89 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  41.89 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  43.14 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  41.55 
 
 		 297 aa  232  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  41.55 
 
 		 297 aa  232  6e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  43.62 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  41.55 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  41.55 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  43.33 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  43.67 
 
 		 299 aa  229  5e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  44.15 
 
 		 308 aa  228  9e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  43.61 
 
 		 309 aa  222  7e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  41.97 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  43.52 
 
 		 309 aa  212  9e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  43.75 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  45.18 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  39.67 
 
 		 302 aa  209  7e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  40.45 
 
 		 306 aa  206  6e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  45.02 
 
 		 308 aa  201  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  44.44 
 
 		 308 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  44.44 
 
 		 308 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  38.87 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  39.4 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  37.24 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  40.17 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  34.94 
 
 		 398 aa  169  8e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  37.12 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  34.11 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.99 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.64 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  37.44 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.37 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  31.49 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.03 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.43 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.62 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  27.01 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.61 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  29.7 
 
 		 318 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  30 
 
 		 318 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  29.94 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  28.81 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  29.45 
 
 		 356 aa  90.5  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  25.68 
 
 		 396 aa  90.5  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>