More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0352 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0352  arginase  100 
 
 		 331 aa  664    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  90.97 
 
 		 325 aa  570  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  75.16 
 
 		 327 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  75.4 
 
 		 328 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  73.23 
 
 		 324 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  73.16 
 
 		 326 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  73.63 
 
 		 328 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  55.1 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  53.75 
 
 		 307 aa  322  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  55.23 
 
 		 322 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  53.9 
 
 		 311 aa  318  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  54.28 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  54.28 
 
 		 308 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  52.92 
 
 		 311 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  53.44 
 
 		 310 aa  306  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  50.79 
 
 		 318 aa  299  6e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  49.04 
 
 		 306 aa  290  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  48.73 
 
 		 306 aa  289  6e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  48.06 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  48.68 
 
 		 306 aa  282  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  48.88 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  47.25 
 
 		 309 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  48.22 
 
 		 308 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  47.23 
 
 		 309 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  48.22 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  48.38 
 
 		 308 aa  259  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  48.37 
 
 		 308 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  48.36 
 
 		 307 aa  258  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  47.27 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  45.45 
 
 		 309 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  48.03 
 
 		 306 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  43.93 
 
 		 306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  45.45 
 
 		 310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  45.69 
 
 		 306 aa  242  7e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  43.28 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  44.98 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  43.27 
 
 		 319 aa  238  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  44.41 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  44.34 
 
 		 304 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  44.74 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  43.09 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  44.3 
 
 		 311 aa  232  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  43.48 
 
 		 341 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  42.72 
 
 		 305 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  42.81 
 
 		 298 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  39.14 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  44.41 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  42.43 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  38.61 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  42.48 
 
 		 302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  42.58 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  44.19 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  44.16 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  41.64 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  42.76 
 
 		 296 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  41.5 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  42.86 
 
 		 282 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  38.82 
 
 		 297 aa  215  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  38.49 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  38.49 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  38.49 
 
 		 297 aa  212  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  38.49 
 
 		 297 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  38.49 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  38.49 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  40.26 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  39.2 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  41.83 
 
 		 299 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  38.16 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  38.16 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  38.16 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  39.67 
 
 		 301 aa  202  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  36.84 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  35.71 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  35.71 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  39.02 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  38.06 
 
 		 306 aa  190  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  38.24 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  35.28 
 
 		 302 aa  187  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  35.21 
 
 		 351 aa  169  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  35.57 
 
 		 301 aa  164  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  31.48 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  35.27 
 
 		 324 aa  143  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  28.48 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.21 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  29.83 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.59 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.25 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.27 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.22 
 
 		 316 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  27.72 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  32.09 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  27.85 
 
 		 396 aa  97.8  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.08 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2759  agmatinase  26.06 
 
 		 333 aa  96.3  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.4 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  31.45 
 
 		 369 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  26.1 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5245  Agmatinase  27.61 
 
 		 396 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.64 
 
 		 335 aa  89.4  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  31.02 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0861741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>