More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2047 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2047  arginase  100 
 
 		 306 aa  618  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  70.63 
 
 		 308 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  62.62 
 
 		 306 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  62.95 
 
 		 306 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  69.97 
 
 		 308 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  70.3 
 
 		 308 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  62.3 
 
 		 306 aa  388  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  64.52 
 
 		 309 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  62.71 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  61.51 
 
 		 310 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  61.31 
 
 		 309 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  59.8 
 
 		 309 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  61.56 
 
 		 308 aa  350  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  58.88 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  55.96 
 
 		 309 aa  315  6e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  54.97 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  54.58 
 
 		 308 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  53.29 
 
 		 311 aa  308  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  51.14 
 
 		 307 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  52.63 
 
 		 311 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  54.61 
 
 		 322 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  51.66 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  50.98 
 
 		 326 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  48.68 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  51.34 
 
 		 318 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  49.34 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  48.36 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  48.69 
 
 		 325 aa  275  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  47.88 
 
 		 331 aa  269  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  47.18 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  45.02 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  45.45 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  45.34 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  46.03 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  45.7 
 
 		 319 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  43.14 
 
 		 321 aa  225  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  43.79 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  44.82 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  44.59 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  46 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  42.95 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  43.29 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  44.37 
 
 		 341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  44.04 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  44.82 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  42.52 
 
 		 315 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  41.31 
 
 		 304 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  41.64 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  39.93 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  42 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  39.03 
 
 		 300 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  40.4 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  40 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  38.94 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  40.51 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  39.39 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  39.39 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  40.51 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  39.73 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  39.73 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  39.39 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  39.39 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  39.39 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  39.39 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  39.39 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  39.39 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  43.31 
 
 		 282 aa  200  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  38.72 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  40.91 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  39 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  37.37 
 
 		 297 aa  189  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  39.67 
 
 		 302 aa  189  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  38.41 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  38.51 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  35.91 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  35.91 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  39.42 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  37.65 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  37.09 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  33.76 
 
 		 398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  35.74 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  32.38 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.11842 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  37.02 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  33.01 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.57 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.29 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  37.31 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.56 
 
 		 309 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.8 
 
 		 309 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  29.87 
 
 		 306 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.38 
 
 		 316 aa  96.7  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  27.8 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  29.67 
 
 		 287 aa  85.9  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1784  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.69 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.23 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.29 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.47 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3402  formimidoylglutamase  29.72 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.786826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3682  formimidoylglutamase  29.72 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0277  agmatinase  28.86 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>