More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0447 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0447  arginase  100 
 
 		 325 aa  653    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  90.97 
 
 		 331 aa  570  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  70.81 
 
 		 324 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  73.08 
 
 		 327 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  72.84 
 
 		 328 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  72.78 
 
 		 328 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  72.67 
 
 		 326 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  54.58 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  53.95 
 
 		 322 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  54.75 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  53.29 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  53.29 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  53.27 
 
 		 311 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  52.46 
 
 		 307 aa  312  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  53.31 
 
 		 310 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  49.83 
 
 		 318 aa  285  7e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  47.76 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  47.44 
 
 		 306 aa  276  4e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  49.52 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  47.06 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  48.43 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  45.83 
 
 		 308 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  47.57 
 
 		 309 aa  266  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  48.69 
 
 		 308 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  47.7 
 
 		 307 aa  261  8e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  48.69 
 
 		 306 aa  260  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  47.04 
 
 		 306 aa  260  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  48.53 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  49.01 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  48.36 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  45.72 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  43.65 
 
 		 306 aa  248  8e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  43.65 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  43.55 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  43.89 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  44.59 
 
 		 321 aa  241  9e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  44.12 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  43.97 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  43.71 
 
 		 341 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  43.85 
 
 		 304 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  45.03 
 
 		 302 aa  238  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  44.16 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  43.14 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  44.44 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  42.53 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  44.41 
 
 		 299 aa  228  9e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  40.07 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  44.06 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  39.87 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  44.33 
 
 		 307 aa  226  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  42.9 
 
 		 298 aa  223  4.9999999999999996e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  40.98 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  41.67 
 
 		 303 aa  219  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  41.18 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  40.95 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  42.76 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  41.72 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  42.76 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  39.87 
 
 		 297 aa  212  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  38.41 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  38.41 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  38.41 
 
 		 297 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  38.41 
 
 		 297 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  38.08 
 
 		 297 aa  209  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  42.11 
 
 		 299 aa  209  7e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  38.08 
 
 		 297 aa  208  9e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  38.08 
 
 		 297 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  38.08 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  38.49 
 
 		 297 aa  205  9e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  37.42 
 
 		 297 aa  205  9e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  39.47 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  36.51 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  38.94 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  37.99 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  35.08 
 
 		 302 aa  187  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  36.72 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  33.66 
 
 		 302 aa  182  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  33.66 
 
 		 302 aa  182  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  36.83 
 
 		 351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  35.79 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  37.61 
 
 		 398 aa  152  8.999999999999999e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  35.69 
 
 		 324 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.88 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  34.83 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  28.04 
 
 		 309 aa  116  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.15 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.81 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.03 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  30.84 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.39 
 
 		 316 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  27.88 
 
 		 306 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2759  agmatinase  26.38 
 
 		 333 aa  94.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.18 
 
 		 335 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  26.96 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.33 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.13 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  28.28 
 
 		 396 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3869  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.03 
 
 		 321 aa  87  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1784  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.92 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  28.9 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0861741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>