More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2891 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2891  arginase  100 
 
 		 307 aa  614  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  78.76 
 
 		 311 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  77.78 
 
 		 311 aa  484  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  62.79 
 
 		 318 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  60.33 
 
 		 308 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  60.53 
 
 		 308 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  60.73 
 
 		 309 aa  350  1e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  56.81 
 
 		 310 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  59.02 
 
 		 322 aa  332  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  55.7 
 
 		 328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  53.75 
 
 		 331 aa  322  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  54.61 
 
 		 324 aa  322  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  53.82 
 
 		 306 aa  320  3e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  53.49 
 
 		 306 aa  318  6e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  53.92 
 
 		 327 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  51.79 
 
 		 326 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  54.46 
 
 		 309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  54.61 
 
 		 309 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  52.46 
 
 		 325 aa  312  4.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  53.11 
 
 		 309 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  53.33 
 
 		 306 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  53.72 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  53.59 
 
 		 308 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  52.77 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  53.77 
 
 		 308 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  49.68 
 
 		 309 aa  286  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  53.42 
 
 		 308 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  53.27 
 
 		 308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  51.14 
 
 		 306 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  51.33 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  48.67 
 
 		 307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  48.52 
 
 		 321 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  47.39 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  48.84 
 
 		 304 aa  269  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  47.85 
 
 		 310 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  47.85 
 
 		 305 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  49.84 
 
 		 304 aa  265  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  46.73 
 
 		 306 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  47.37 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  44.12 
 
 		 321 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  47.04 
 
 		 302 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  47.04 
 
 		 319 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  46.41 
 
 		 341 aa  253  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  49.29 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  45.85 
 
 		 307 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  44.19 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  44.04 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  43.28 
 
 		 298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  43.51 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  40.13 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  44.27 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  44.59 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  41.83 
 
 		 315 aa  238  8e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  44.37 
 
 		 302 aa  235  8e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  43.61 
 
 		 299 aa  229  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  43.65 
 
 		 301 aa  230  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  39.02 
 
 		 299 aa  228  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  42.47 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  42.81 
 
 		 299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  42.19 
 
 		 307 aa  225  7e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  41.23 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  40.13 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  38.46 
 
 		 297 aa  219  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  38.13 
 
 		 297 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  41.33 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  37.17 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  37.17 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  38.13 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  38.8 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  38.46 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  38.46 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  38.46 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  38.46 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  38.46 
 
 		 297 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  38.46 
 
 		 297 aa  215  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  37.46 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  40.39 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  39.53 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  36.61 
 
 		 351 aa  199  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  39.46 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  33.02 
 
 		 398 aa  172  5e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  37.19 
 
 		 324 aa  163  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  31.12 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.89 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  32.33 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.91 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.33 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.99 
 
 		 309 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.28 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.89 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  30.03 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  33.45 
 
 		 301 aa  122  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  26.84 
 
 		 314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.32 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3757  formimidoylglutamase  30.1 
 
 		 323 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3336  formimidoylglutamase  28.76 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.301376  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1559  formimidoylglutamase  29.57 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459006  normal  0.0875298 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  30.26 
 
 		 323 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3402  formimidoylglutamase  29.9 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.786826  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.54 
 
 		 335 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>