More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2309 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2309  arginase  100 
 
 		 308 aa  620  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  65.26 
 
 		 309 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  61.49 
 
 		 309 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  59.54 
 
 		 306 aa  360  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  59.21 
 
 		 306 aa  358  5e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  61.36 
 
 		 309 aa  358  6e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  61.76 
 
 		 310 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  65.35 
 
 		 308 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  62.09 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  59.67 
 
 		 306 aa  350  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  64.47 
 
 		 308 aa  350  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  64.47 
 
 		 308 aa  349  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  62.71 
 
 		 306 aa  341  7e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  60.13 
 
 		 308 aa  332  6e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  56.17 
 
 		 311 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  55.84 
 
 		 311 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  53.59 
 
 		 307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  55.05 
 
 		 322 aa  300  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  54.49 
 
 		 308 aa  296  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  53.11 
 
 		 318 aa  296  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  54.67 
 
 		 308 aa  295  7e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  53.67 
 
 		 309 aa  290  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  47.06 
 
 		 324 aa  285  9e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  48.06 
 
 		 331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  46.95 
 
 		 327 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  47.1 
 
 		 328 aa  279  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  47.27 
 
 		 326 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  46.96 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  45.83 
 
 		 325 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  47.49 
 
 		 307 aa  245  8e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  45.9 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  45.9 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  45.97 
 
 		 307 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  44.22 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  46.51 
 
 		 321 aa  235  6e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  47.35 
 
 		 341 aa  235  7e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  46.49 
 
 		 306 aa  235  7e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  44.84 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  46.69 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  44.77 
 
 		 321 aa  231  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  44.59 
 
 		 306 aa  231  8.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  46.23 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  45.03 
 
 		 304 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  44.59 
 
 		 304 aa  228  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  46.1 
 
 		 282 aa  228  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  43.96 
 
 		 302 aa  225  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  40.33 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  41.25 
 
 		 296 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  42.67 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  41.61 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  39.67 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  41.53 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  41.08 
 
 		 303 aa  212  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  39.07 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  40.26 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  39.54 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  38.61 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  40.39 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  38.61 
 
 		 297 aa  205  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  41.04 
 
 		 299 aa  205  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  38.74 
 
 		 297 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  38 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  38 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  38.28 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  38.28 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  38.28 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  38 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  38.28 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  38.28 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  42.38 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  39.35 
 
 		 301 aa  203  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  39.47 
 
 		 308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  39.35 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  39.87 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  36.96 
 
 		 297 aa  198  9e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  35.86 
 
 		 302 aa  198  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  39.8 
 
 		 307 aa  198  9e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  35.86 
 
 		 302 aa  198  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  34.53 
 
 		 351 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  33.64 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  33.66 
 
 		 301 aa  152  8.999999999999999e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  32.63 
 
 		 317 aa  145  7.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.11842 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  34.2 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  33.77 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.33 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.58 
 
 		 315 aa  125  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.09 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  34.03 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  29.61 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  28.11 
 
 		 314 aa  105  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.28 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.9 
 
 		 316 aa  102  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1784  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.41 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  23.97 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1433  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.82 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0455111  normal  0.0134967 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2759  agmatinase  26.2 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2852  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.34 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4687  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.57 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3869  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.5 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>