More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3917 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3917  arginase  100 
 
 
311 aa  621  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  96.46 
 
 
311 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  77.78 
 
 
307 aa  484  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  58.42 
 
 
318 aa  344  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  58.22 
 
 
308 aa  333  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  58.42 
 
 
308 aa  332  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  58.5 
 
 
322 aa  330  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  57.19 
 
 
309 aa  329  4e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  57.24 
 
 
310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  55.84 
 
 
308 aa  320  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  53.62 
 
 
306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  53.29 
 
 
306 aa  318  6e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  53.23 
 
 
324 aa  315  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  54.9 
 
 
309 aa  315  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  53.27 
 
 
325 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  52.92 
 
 
331 aa  311  6.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  53.11 
 
 
327 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  55.56 
 
 
308 aa  311  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  53.75 
 
 
328 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  54.55 
 
 
309 aa  309  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  54.28 
 
 
309 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  52.12 
 
 
328 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  52.96 
 
 
306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  50.49 
 
 
326 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  53.42 
 
 
308 aa  295  9e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  52.94 
 
 
308 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  50.81 
 
 
309 aa  293  3e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  52.63 
 
 
306 aa  291  8e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  53.25 
 
 
308 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  48.56 
 
 
307 aa  278  9e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  50 
 
 
311 aa  271  7e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  47.68 
 
 
302 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  48.21 
 
 
321 aa  269  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  46.25 
 
 
321 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  47.59 
 
 
306 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  47.23 
 
 
310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  46.13 
 
 
306 aa  262  6e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  45.81 
 
 
306 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  47.42 
 
 
319 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  46.51 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  43.38 
 
 
300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  46.56 
 
 
304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  47.06 
 
 
306 aa  253  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  46.56 
 
 
304 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  44.77 
 
 
298 aa  252  5.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  45.48 
 
 
305 aa  252  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  42.67 
 
 
315 aa  251  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  49.47 
 
 
282 aa  251  9.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  45.31 
 
 
298 aa  250  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  46.36 
 
 
302 aa  246  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  46.75 
 
 
341 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  45.07 
 
 
308 aa  245  8e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  45.72 
 
 
299 aa  245  9e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  41.67 
 
 
297 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  41.67 
 
 
297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  41.67 
 
 
297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  45.85 
 
 
299 aa  243  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  44.19 
 
 
306 aa  243  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  42.05 
 
 
299 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  42 
 
 
297 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  41.67 
 
 
297 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  41.67 
 
 
297 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  41.67 
 
 
297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  41.33 
 
 
297 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  41.67 
 
 
297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  45.39 
 
 
299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  45.95 
 
 
307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  44.37 
 
 
303 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  41.67 
 
 
297 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  41.67 
 
 
297 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  42.19 
 
 
297 aa  238  6.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  43.09 
 
 
301 aa  235  7e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  42.67 
 
 
307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  43.33 
 
 
296 aa  232  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  40.85 
 
 
302 aa  226  4e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  38.87 
 
 
351 aa  218  8.999999999999998e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  41.31 
 
 
301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  37.79 
 
 
302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  37.79 
 
 
302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  40.33 
 
 
301 aa  179  5.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  33.23 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  40.42 
 
 
324 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  32.18 
 
 
317 aa  149  8e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  36.2 
 
 
301 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  33.44 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.61 
 
 
315 aa  135  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.32 
 
 
309 aa  133  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.76 
 
 
319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  31.19 
 
 
306 aa  126  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.65 
 
 
309 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.97 
 
 
309 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.7 
 
 
316 aa  122  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.21 
 
 
315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  28.83 
 
 
314 aa  112  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1784  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.98 
 
 
334 aa  112  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.97 
 
 
335 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  30.74 
 
 
323 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3439  formimidoylglutamase  29.74 
 
 
323 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3336  formimidoylglutamase  29.74 
 
 
323 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.301376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3659  formimidoylglutamase  29.74 
 
 
323 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>