More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0158 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0158  arginase  100 
 
 		 309 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  85.76 
 
 		 309 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  84.79 
 
 		 309 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  48.3 
 
 		 306 aa  241  9e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  43.51 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  46.62 
 
 		 301 aa  205  7e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  37.76 
 
 		 315 aa  185  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  38.05 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  39.14 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  38.23 
 
 		 315 aa  178  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  36.45 
 
 		 300 aa  175  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  33.9 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  34.12 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  35.49 
 
 		 297 aa  165  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  36.18 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  36.18 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  36.18 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  37.12 
 
 		 321 aa  163  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  37.92 
 
 		 299 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  36.18 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  36.18 
 
 		 297 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  36.18 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  36.18 
 
 		 297 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  36.49 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  36.18 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  36.18 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  36.61 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  36.18 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  37.83 
 
 		 306 aa  159  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  37.83 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  34.01 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  35.23 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  31.44 
 
 		 302 aa  152  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  31.44 
 
 		 302 aa  152  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  34.3 
 
 		 304 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  34.62 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  35.06 
 
 		 310 aa  148  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  36.18 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  34.15 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  32.31 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  34.9 
 
 		 306 aa  142  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  35.29 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  33.45 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  34.74 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.13 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  34.9 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  32.45 
 
 		 304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  33.44 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  35.23 
 
 		 307 aa  139  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  34.39 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  34.08 
 
 		 305 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  33.44 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  32.33 
 
 		 307 aa  135  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  39.13 
 
 		 298 aa  135  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  34.56 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  35.66 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  33.45 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  31.21 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  33.77 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  33 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  32.55 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  33.11 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  35.68 
 
 		 321 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  32.67 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  36.17 
 
 		 351 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  34.43 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  33.78 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  32.32 
 
 		 301 aa  125  6e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  32.89 
 
 		 309 aa  125  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  31.19 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  33.33 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  34.45 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.17 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  30.97 
 
 		 310 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  32.67 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  32.55 
 
 		 324 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  31.1 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  29.41 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  30.43 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  30.07 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  32.46 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  33.89 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  29.83 
 
 		 331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  33.96 
 
 		 327 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  28.04 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  33.56 
 
 		 308 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  31.45 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  31.44 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  31.45 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  29.94 
 
 		 328 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  37.38 
 
 		 356 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  30.45 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  34.39 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.39 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.42 
 
 		 335 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  25.9 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0654  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.21 
 
 		 310 aa  95.9  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  29.92 
 
 		 346 aa  95.9  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  33.8 
 
 		 322 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3224  agmatinase  34.65 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>