More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5460 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 
315 aa  641    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  42.27 
 
 
309 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  49.13 
 
 
301 aa  215  8e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  38.57 
 
 
306 aa  198  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  42.06 
 
 
298 aa  192  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  37.76 
 
 
309 aa  185  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38.75 
 
 
309 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38.41 
 
 
309 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  37.97 
 
 
300 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  38.68 
 
 
299 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  40.43 
 
 
297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  38.29 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  38.29 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  37.84 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  40.27 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  37.84 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  38.29 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  40.61 
 
 
302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  37.84 
 
 
297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  37.84 
 
 
297 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  37.84 
 
 
297 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  40.27 
 
 
299 aa  162  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  37.84 
 
 
297 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  37.84 
 
 
297 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  42.33 
 
 
306 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  36.94 
 
 
297 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  41.86 
 
 
306 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  37.61 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  39.13 
 
 
308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  33.22 
 
 
305 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  33.99 
 
 
321 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  40 
 
 
310 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  32.09 
 
 
307 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  37.67 
 
 
282 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  39.44 
 
 
302 aa  150  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  32.46 
 
 
306 aa  150  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  36.86 
 
 
315 aa  149  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  38.5 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  37.39 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  31.68 
 
 
307 aa  145  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  37.14 
 
 
301 aa  146  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  31.54 
 
 
304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  37.17 
 
 
301 aa  145  9e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  40.5 
 
 
299 aa  145  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  37.38 
 
 
319 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  32.13 
 
 
298 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  37.21 
 
 
302 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  37.44 
 
 
306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  35.98 
 
 
321 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  33.86 
 
 
341 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  32.33 
 
 
311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  35.25 
 
 
311 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  37.18 
 
 
307 aa  136  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  33.61 
 
 
311 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  30.77 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  30.77 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  32.91 
 
 
307 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  34.19 
 
 
303 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  33.22 
 
 
318 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.43 
 
 
316 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.13 
 
 
315 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  34.57 
 
 
306 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  34.57 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  35.32 
 
 
324 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  34.48 
 
 
309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  33.33 
 
 
296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  33.47 
 
 
351 aa  126  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  35.74 
 
 
308 aa  125  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  35.74 
 
 
308 aa  125  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  35.55 
 
 
306 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  34.58 
 
 
308 aa  125  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  34.26 
 
 
301 aa  124  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  34.6 
 
 
398 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  30.29 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.9 
 
 
319 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  35.71 
 
 
309 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  37.62 
 
 
322 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  33.33 
 
 
326 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  33.48 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  34.18 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  36.07 
 
 
308 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  33.61 
 
 
309 aa  112  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  34.27 
 
 
331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  28.99 
 
 
309 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  35.21 
 
 
327 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  32.08 
 
 
310 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  29.69 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  36.49 
 
 
308 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  36.02 
 
 
308 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  35.62 
 
 
324 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  36.49 
 
 
308 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  32.03 
 
 
325 aa  106  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  33.8 
 
 
328 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  29.35 
 
 
369 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  35.29 
 
 
306 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  32.2 
 
 
322 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  26.42 
 
 
365 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  26.42 
 
 
365 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  26.42 
 
 
365 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4687  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.82 
 
 
300 aa  99  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>