More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4803 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4803  arginase  100 
 
 		 307 aa  620  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  69.31 
 
 		 306 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  68.98 
 
 		 306 aa  424  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  67.22 
 
 		 304 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  66.89 
 
 		 305 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  64.21 
 
 		 311 aa  388  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  65.89 
 
 		 310 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  64.67 
 
 		 321 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  65.66 
 
 		 302 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  62.88 
 
 		 304 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  63.37 
 
 		 341 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  62.54 
 
 		 307 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  64.78 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  62.33 
 
 		 306 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  63.7 
 
 		 282 aa  362  5.0000000000000005e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  63.33 
 
 		 319 aa  351  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  47 
 
 		 298 aa  264  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  48.68 
 
 		 308 aa  255  6e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  47.54 
 
 		 309 aa  255  7e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  48.34 
 
 		 308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  45.82 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  45.85 
 
 		 307 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  46.93 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  46.28 
 
 		 311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  45.03 
 
 		 302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  45.03 
 
 		 300 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  45.95 
 
 		 311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  45.97 
 
 		 308 aa  239  5.999999999999999e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  44.33 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  44.48 
 
 		 299 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  44.44 
 
 		 301 aa  235  8e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  45.61 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  44.52 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  43.14 
 
 		 306 aa  229  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  44 
 
 		 308 aa  228  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  42.03 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  44.48 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  45.25 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  42.03 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  42.03 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  42.37 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  45.3 
 
 		 324 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  44.33 
 
 		 325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  42.03 
 
 		 297 aa  226  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  42.03 
 
 		 297 aa  226  6e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  43.43 
 
 		 303 aa  225  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  42.03 
 
 		 297 aa  225  9e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  42.03 
 
 		 297 aa  225  9e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  42.03 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  43.67 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  42.03 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  44.12 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  43.97 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  41.41 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  44.19 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  43.79 
 
 		 301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  41.86 
 
 		 306 aa  219  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  41.36 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  41.53 
 
 		 306 aa  218  8.999999999999998e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  44.04 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  43.51 
 
 		 328 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  42.72 
 
 		 309 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  42.33 
 
 		 309 aa  212  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  42.67 
 
 		 310 aa  212  7.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  41.72 
 
 		 306 aa  209  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  41.08 
 
 		 306 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  36.63 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  36.63 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  39.67 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  39.6 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  45.03 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  45.36 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  39.39 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  41.67 
 
 		 307 aa  201  9e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  41.86 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  39.47 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  44.82 
 
 		 306 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  44.37 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  41.97 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  37.96 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  35.31 
 
 		 301 aa  159  8e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  34.86 
 
 		 398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.09 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  32.51 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.13 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  35.23 
 
 		 309 aa  139  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.81 
 
 		 309 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.21 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  34.92 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.54 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.05 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  30.2 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  26.98 
 
 		 314 aa  112  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.37 
 
 		 335 aa  95.9  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  22.48 
 
 		 319 aa  95.5  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2759  agmatinase  25.33 
 
 		 333 aa  85.9  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1784  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.92 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  28.09 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1296  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.75 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.925134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  30.1 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>