More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0241 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  100 
 
 
306 aa  619  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  99.02 
 
 
306 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  69.31 
 
 
307 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  67.77 
 
 
310 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  66.23 
 
 
321 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  65.78 
 
 
304 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  65.45 
 
 
305 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  66.45 
 
 
302 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  64.14 
 
 
304 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  64.12 
 
 
311 aa  396  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  63.79 
 
 
307 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  67.33 
 
 
321 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  62.58 
 
 
306 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  64.8 
 
 
319 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  64.66 
 
 
282 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  64.69 
 
 
341 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  50.49 
 
 
308 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  50.16 
 
 
308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  48.36 
 
 
309 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  46.73 
 
 
307 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  46.18 
 
 
315 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  44.59 
 
 
299 aa  259  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  45.81 
 
 
311 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  43.46 
 
 
300 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  45.81 
 
 
311 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  49.67 
 
 
322 aa  255  7e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  44.3 
 
 
324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  45.45 
 
 
326 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  42.09 
 
 
297 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  41.75 
 
 
297 aa  249  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  41.75 
 
 
297 aa  249  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  43.65 
 
 
325 aa  248  7e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  41.75 
 
 
297 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  43.28 
 
 
298 aa  247  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  41.75 
 
 
297 aa  246  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  41.75 
 
 
297 aa  246  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  45.39 
 
 
299 aa  246  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  43.14 
 
 
301 aa  245  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  41.41 
 
 
297 aa  245  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  41.41 
 
 
297 aa  245  8e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  41.41 
 
 
297 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  46.33 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  41.41 
 
 
297 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  43.28 
 
 
331 aa  241  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  40.74 
 
 
297 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  45.9 
 
 
308 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  44.48 
 
 
327 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  44.88 
 
 
299 aa  236  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  45.07 
 
 
302 aa  237  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  44.48 
 
 
328 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  45.02 
 
 
306 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  43.14 
 
 
303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  44.52 
 
 
328 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  46.53 
 
 
309 aa  231  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  38.11 
 
 
302 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  43.19 
 
 
296 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  38.11 
 
 
302 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  43.75 
 
 
306 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  44.37 
 
 
310 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  44.01 
 
 
301 aa  229  4e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  43.42 
 
 
306 aa  229  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  40.72 
 
 
297 aa  229  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  45.28 
 
 
309 aa  229  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  44.33 
 
 
299 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  43.09 
 
 
306 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  45.6 
 
 
309 aa  222  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  41.47 
 
 
298 aa  222  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  41.56 
 
 
298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  40.98 
 
 
302 aa  219  5e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  41.85 
 
 
306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  44.34 
 
 
308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  44.04 
 
 
309 aa  211  9e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  45.02 
 
 
306 aa  209  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  39.33 
 
 
308 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  43.93 
 
 
308 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  43.93 
 
 
308 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  44.26 
 
 
308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  38.31 
 
 
307 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  37.57 
 
 
351 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  41.84 
 
 
324 aa  172  6.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  36.42 
 
 
301 aa  170  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  34.28 
 
 
398 aa  161  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  37.83 
 
 
309 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  41.86 
 
 
315 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  33.33 
 
 
317 aa  154  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.22 
 
 
309 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38.13 
 
 
309 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  37.04 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.81 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.79 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  31.1 
 
 
306 aa  129  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  27.88 
 
 
314 aa  125  9e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.24 
 
 
315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  23.49 
 
 
319 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.83 
 
 
335 aa  99.8  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  31.56 
 
 
356 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  30.39 
 
 
356 aa  93.2  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5245  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.76 
 
 
307 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341043  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  31.44 
 
 
318 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  27.67 
 
 
291 aa  87  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>