More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0203 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0203  arginase  100 
 
 		 308 aa  608  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  67.43 
 
 		 309 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  65.36 
 
 		 306 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  65.03 
 
 		 306 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  67.76 
 
 		 309 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  66.12 
 
 		 309 aa  391  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  64.8 
 
 		 310 aa  391  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  64.38 
 
 		 306 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  60.13 
 
 		 308 aa  341  1e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  60.59 
 
 		 306 aa  337  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  56.21 
 
 		 311 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  58.77 
 
 		 308 aa  321  8e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  58.77 
 
 		 308 aa  319  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  55.56 
 
 		 311 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  57.47 
 
 		 308 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  54.98 
 
 		 309 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  56.29 
 
 		 308 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  56.29 
 
 		 308 aa  301  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  55.59 
 
 		 309 aa  297  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  52.77 
 
 		 307 aa  296  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  57.84 
 
 		 322 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  49.03 
 
 		 328 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  52.32 
 
 		 318 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  49.35 
 
 		 327 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  49.02 
 
 		 325 aa  268  7e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  48.7 
 
 		 331 aa  266  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  48.7 
 
 		 328 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  49.67 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  45.22 
 
 		 326 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  47.67 
 
 		 307 aa  246  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  46.13 
 
 		 306 aa  242  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  45.63 
 
 		 310 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  44.98 
 
 		 306 aa  222  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  43.61 
 
 		 319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  44.66 
 
 		 306 aa  219  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  43.55 
 
 		 302 aa  218  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  44.04 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  45.33 
 
 		 311 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  44.9 
 
 		 341 aa  215  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  44.33 
 
 		 306 aa  215  8e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  43.65 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  43.28 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  40.86 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  42.43 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  42.76 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  40.67 
 
 		 297 aa  212  7.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  39.55 
 
 		 300 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  41.04 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  44.01 
 
 		 304 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  42.76 
 
 		 304 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  40.48 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  42.38 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  39.94 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  42.11 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  45.23 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  42.11 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  42.48 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  41.39 
 
 		 303 aa  202  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  36.63 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  37.62 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  37.62 
 
 		 297 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  41.1 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  37.62 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  41.97 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  37.62 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  37.62 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  37.29 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  37.29 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  40.85 
 
 		 301 aa  197  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  37.29 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  37.29 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  37.95 
 
 		 297 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  38.96 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  39.6 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  41.2 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  36.98 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  36.87 
 
 		 351 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  34.98 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  34.98 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  31.94 
 
 		 398 aa  150  3e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  35.22 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  31.6 
 
 		 317 aa  135  6.0000000000000005e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.23 
 
 		 309 aa  132  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  34.55 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  34.97 
 
 		 301 aa  122  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  31.61 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.07 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  30.3 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.26 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.77 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.06 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.81 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  28.51 
 
 		 314 aa  90.9  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.38 
 
 		 315 aa  89.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1784  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.57 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.58 
 
 		 335 aa  79  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2384  agmatinase  31.05 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  27.62 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4687  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.6 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2793  agmatinase  29.97 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.66818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>