More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1712 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 
309 aa  617  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  42.27 
 
 
315 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  48.78 
 
 
301 aa  241  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  43.51 
 
 
309 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  43.36 
 
 
306 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  43.83 
 
 
309 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  43.83 
 
 
309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  40.13 
 
 
300 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  42.09 
 
 
298 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  39.73 
 
 
299 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  40.27 
 
 
299 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  38.13 
 
 
299 aa  185  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  38.05 
 
 
308 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  37.07 
 
 
297 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  40.13 
 
 
298 aa  179  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  36.73 
 
 
297 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  37.5 
 
 
302 aa  179  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  39.12 
 
 
299 aa  178  8e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  36.73 
 
 
297 aa  179  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  36.39 
 
 
297 aa  178  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  36.73 
 
 
297 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  36.73 
 
 
297 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  36.39 
 
 
297 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  36.73 
 
 
297 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  36.73 
 
 
297 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  36.73 
 
 
297 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  36.73 
 
 
297 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  36.99 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  38.72 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  37.58 
 
 
303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  39.86 
 
 
298 aa  169  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  38.23 
 
 
306 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  36.86 
 
 
296 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  35.79 
 
 
302 aa  166  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  36.21 
 
 
307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  34.22 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  37.16 
 
 
321 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  36.21 
 
 
301 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  34.42 
 
 
306 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  34.46 
 
 
304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  33.89 
 
 
306 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  35.69 
 
 
307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  34.45 
 
 
306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  33.88 
 
 
302 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  33.88 
 
 
302 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  33.22 
 
 
306 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  33.22 
 
 
304 aa  149  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  35.15 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  35.64 
 
 
321 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  31.89 
 
 
307 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  33.78 
 
 
305 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.27 
 
 
315 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  34.45 
 
 
302 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  36.04 
 
 
341 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  32.13 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  33.45 
 
 
319 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  33.45 
 
 
308 aa  136  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  32.79 
 
 
308 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  32.99 
 
 
311 aa  136  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  32.77 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  35.68 
 
 
282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  32.32 
 
 
311 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.52 
 
 
316 aa  132  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.239055 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  37.5 
 
 
324 aa  132  9e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  33.45 
 
 
309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  35.56 
 
 
351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  35.02 
 
 
310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  35.19 
 
 
322 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  32.33 
 
 
308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  32.42 
 
 
318 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  30.87 
 
 
306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  30.87 
 
 
306 aa  126  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  32.9 
 
 
308 aa  126  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  30.85 
 
 
306 aa  125  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  31.8 
 
 
309 aa  125  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.75 
 
 
319 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  33.11 
 
 
308 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  31.88 
 
 
325 aa  122  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  35.68 
 
 
398 aa  122  9e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  32.21 
 
 
331 aa  122  9e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  31.6 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  30.64 
 
 
324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  31.41 
 
 
309 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  30.64 
 
 
328 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  31.53 
 
 
309 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  38.03 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  30.98 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  38.03 
 
 
308 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  35.57 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  29.97 
 
 
328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  30.77 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  30.3 
 
 
314 aa  108  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  28.36 
 
 
317 aa  107  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  32.01 
 
 
306 aa  106  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3606  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.08 
 
 
389 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0938214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3987  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.23 
 
 
395 aa  102  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1296  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.16 
 
 
305 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.925134 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5245  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.2 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341043  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1926  Arginase/agmatinase/formimino glutamase  30.55 
 
 
295 aa  96.3  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  31.07 
 
 
323 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>