More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0965 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0965  arginase  100 
 
 
341 aa  678    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  73.27 
 
 
311 aa  451  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  71.05 
 
 
307 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  71.48 
 
 
304 aa  437  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  70.96 
 
 
305 aa  437  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  68.4 
 
 
321 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  72.63 
 
 
282 aa  425  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  70.07 
 
 
310 aa  422  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  67.99 
 
 
306 aa  421  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  65.57 
 
 
304 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  65.68 
 
 
306 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  65.68 
 
 
306 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  63.37 
 
 
307 aa  388  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  62.3 
 
 
302 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  63.81 
 
 
319 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  63.73 
 
 
321 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  50.8 
 
 
308 aa  272  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  50.8 
 
 
308 aa  272  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  50.32 
 
 
309 aa  270  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  46.41 
 
 
307 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  51.61 
 
 
322 aa  259  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  46.75 
 
 
311 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  44.59 
 
 
298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  47.42 
 
 
324 aa  252  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  45.02 
 
 
315 aa  249  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  45.63 
 
 
311 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  45.66 
 
 
325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  47.44 
 
 
327 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  46.75 
 
 
318 aa  245  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  47.87 
 
 
302 aa  244  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  47.52 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  46.25 
 
 
328 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  44.81 
 
 
308 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  45.82 
 
 
328 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  41.91 
 
 
301 aa  242  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  48.2 
 
 
309 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  47.57 
 
 
299 aa  241  9e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  44.81 
 
 
298 aa  240  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  47.35 
 
 
308 aa  239  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  47.19 
 
 
309 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  44.95 
 
 
306 aa  237  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  46.75 
 
 
299 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  44.63 
 
 
306 aa  236  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  44.76 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  45.18 
 
 
303 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  45.18 
 
 
296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  42.43 
 
 
298 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  40.07 
 
 
300 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  40.58 
 
 
299 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  44.37 
 
 
306 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  44.13 
 
 
326 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  45.87 
 
 
309 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  43.83 
 
 
306 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  42.67 
 
 
299 aa  225  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  41.78 
 
 
297 aa  223  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  38.87 
 
 
297 aa  222  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  41.56 
 
 
301 aa  222  8e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  38.87 
 
 
297 aa  222  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  38.87 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  46.28 
 
 
308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  38.87 
 
 
297 aa  219  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  38.87 
 
 
297 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  38.87 
 
 
297 aa  219  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  36.36 
 
 
302 aa  218  7.999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  36.36 
 
 
302 aa  218  7.999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  38.54 
 
 
297 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  38.54 
 
 
297 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  38.54 
 
 
297 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  38.54 
 
 
297 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  38.21 
 
 
297 aa  215  9e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  45.21 
 
 
306 aa  209  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  37.94 
 
 
302 aa  206  5e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  42.02 
 
 
309 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  46.2 
 
 
308 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  45.87 
 
 
308 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  45.54 
 
 
308 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  39.1 
 
 
306 aa  200  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  37.3 
 
 
307 aa  189  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  35.36 
 
 
351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  36.54 
 
 
301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  39.01 
 
 
324 aa  161  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  33.72 
 
 
398 aa  160  4e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  33.1 
 
 
317 aa  151  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.86 
 
 
315 aa  149  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  35.29 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.36 
 
 
309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.79 
 
 
316 aa  146  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  31.25 
 
 
306 aa  139  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  35.39 
 
 
301 aa  137  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.85 
 
 
315 aa  136  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.89 
 
 
309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.56 
 
 
309 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  28.39 
 
 
314 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.25 
 
 
319 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.3 
 
 
335 aa  96.7  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  25.93 
 
 
396 aa  93.6  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  30.35 
 
 
356 aa  94  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  31.85 
 
 
369 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  31.36 
 
 
345 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  31.36 
 
 
345 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>