More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2778 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  99.13 
 
 
345 aa  693    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  100 
 
 
345 aa  696    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  100 
 
 
345 aa  696    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  90.88 
 
 
340 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3024  putative agmatinase  89.44 
 
 
354 aa  607  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197883  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0848  agmatinase  64.79 
 
 
340 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384974  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  63.5 
 
 
346 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  62.01 
 
 
369 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4832  agmatinase  60.37 
 
 
378 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3224  agmatinase  53.72 
 
 
333 aa  295  6e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  49 
 
 
365 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  49 
 
 
365 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  48.67 
 
 
365 aa  285  8e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4346  Agmatinase  50.16 
 
 
478 aa  279  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1743  agmatinase  53.36 
 
 
346 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  48.93 
 
 
356 aa  260  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4275  agmatinase  47.27 
 
 
321 aa  248  9e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  42.16 
 
 
317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0094  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38.38 
 
 
382 aa  199  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284033  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  42.11 
 
 
320 aa  199  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  42.09 
 
 
318 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  41.16 
 
 
315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  38.72 
 
 
317 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  35.29 
 
 
396 aa  194  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  39.87 
 
 
317 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  39.87 
 
 
317 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  39.87 
 
 
317 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  39.87 
 
 
317 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  38.05 
 
 
316 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  39.87 
 
 
317 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0814  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  37.04 
 
 
385 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.237989  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  40.72 
 
 
351 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  39.14 
 
 
315 aa  193  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  39.53 
 
 
317 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  38.05 
 
 
316 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  39.29 
 
 
316 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  41.07 
 
 
325 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  40.07 
 
 
352 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  39.02 
 
 
324 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  38.67 
 
 
319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  39.09 
 
 
351 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  38.33 
 
 
319 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  38.91 
 
 
333 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  38.08 
 
 
329 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  37.9 
 
 
310 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  40.13 
 
 
315 aa  189  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  38 
 
 
319 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  39.64 
 
 
329 aa  188  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  38.26 
 
 
318 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  38.33 
 
 
318 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5245  Agmatinase  35.29 
 
 
396 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  38.19 
 
 
318 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  39 
 
 
316 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  40.29 
 
 
315 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  39.75 
 
 
321 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  38.32 
 
 
345 aa  186  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  41.78 
 
 
324 aa  186  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  40 
 
 
319 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  40 
 
 
319 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  40 
 
 
319 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  38.41 
 
 
322 aa  186  5e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  37.67 
 
 
320 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  37.67 
 
 
320 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  37.86 
 
 
318 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  37 
 
 
354 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  37 
 
 
354 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  40.97 
 
 
369 aa  186  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  37.67 
 
 
316 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  37.67 
 
 
320 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  38.41 
 
 
327 aa  185  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  37.69 
 
 
324 aa  185  8e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  39.27 
 
 
322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  39.82 
 
 
321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  41.74 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  36.53 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  42.6 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  42.6 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  42.6 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  38.61 
 
 
306 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  36.11 
 
 
315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  41.67 
 
 
326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  41.67 
 
 
326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  41.67 
 
 
326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  39.94 
 
 
337 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6439  agmatinase  38.44 
 
 
351 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0137522 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  38.96 
 
 
354 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  38.24 
 
 
330 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40880  agmatinase  34.84 
 
 
416 aa  181  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  39.3 
 
 
320 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  38.39 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  37.01 
 
 
315 aa  179  8e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0743  agmatinase  34.05 
 
 
401 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618135  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  38.49 
 
 
342 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  39.64 
 
 
321 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  38.46 
 
 
356 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  37.1 
 
 
319 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  37.77 
 
 
329 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  37.66 
 
 
378 aa  176  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.01 
 
 
335 aa  176  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  35.97 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>