More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4346 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4346  Agmatinase  100 
 
 
478 aa  965    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  49.84 
 
 
369 aa  279  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  48.21 
 
 
340 aa  276  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  50.32 
 
 
346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0848  agmatinase  48.94 
 
 
340 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384974  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  50.81 
 
 
345 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  50.81 
 
 
345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  50.81 
 
 
345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3024  putative agmatinase  47.28 
 
 
354 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197883  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  42.55 
 
 
365 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4832  agmatinase  45.51 
 
 
378 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  42.24 
 
 
365 aa  246  9e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  42.24 
 
 
365 aa  246  9e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3224  agmatinase  44.27 
 
 
333 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  43.51 
 
 
356 aa  233  7.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4275  agmatinase  43.96 
 
 
321 aa  225  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1743  agmatinase  42.33 
 
 
346 aa  223  7e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  38.46 
 
 
316 aa  183  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  40.06 
 
 
333 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  38.53 
 
 
345 aa  177  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  38.77 
 
 
316 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  38.35 
 
 
369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5245  Agmatinase  34.81 
 
 
396 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  38.34 
 
 
330 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  37.42 
 
 
317 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  37.42 
 
 
317 aa  170  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  37.42 
 
 
317 aa  170  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  37.42 
 
 
317 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  37.42 
 
 
317 aa  170  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  37.11 
 
 
317 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  36.42 
 
 
320 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  36.9 
 
 
326 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  36.9 
 
 
326 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  36.42 
 
 
316 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  36.9 
 
 
326 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  36.42 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  35.48 
 
 
319 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  36.39 
 
 
318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  36.39 
 
 
318 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  36.42 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  37.77 
 
 
317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  36.39 
 
 
329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  36.39 
 
 
318 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  37.3 
 
 
318 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  35.78 
 
 
315 aa  167  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  36.09 
 
 
354 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  36.09 
 
 
354 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  37.38 
 
 
315 aa  166  8e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  36.09 
 
 
318 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  37.38 
 
 
317 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  35.96 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  36.1 
 
 
319 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  36.89 
 
 
337 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  38.02 
 
 
351 aa  165  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  34.07 
 
 
396 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  38.61 
 
 
310 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  37.3 
 
 
318 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  38.24 
 
 
315 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  35.93 
 
 
329 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  36.74 
 
 
342 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  36.19 
 
 
334 aa  163  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  36.99 
 
 
321 aa  163  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  36.09 
 
 
321 aa  163  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  37.66 
 
 
334 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  36.1 
 
 
316 aa  161  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  37.73 
 
 
320 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  35.46 
 
 
319 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  37.22 
 
 
305 aa  160  4e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  37.66 
 
 
316 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  37.08 
 
 
315 aa  160  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  35.46 
 
 
319 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  36.77 
 
 
352 aa  160  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  35.4 
 
 
322 aa  160  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  35.87 
 
 
318 aa  159  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  35.84 
 
 
322 aa  159  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  37.19 
 
 
316 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  35.74 
 
 
351 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  34.5 
 
 
315 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  34.28 
 
 
320 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  35.87 
 
 
324 aa  156  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  35.95 
 
 
327 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  36.73 
 
 
315 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  36.77 
 
 
306 aa  154  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  34.82 
 
 
318 aa  153  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  36.72 
 
 
318 aa  153  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3103  agmatinase  35.05 
 
 
323 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  34.85 
 
 
325 aa  152  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  34.09 
 
 
324 aa  152  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6439  agmatinase  35.74 
 
 
351 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0137522 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  37.93 
 
 
313 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  36.72 
 
 
321 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  34.39 
 
 
319 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  34.39 
 
 
319 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  34.39 
 
 
319 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  33.15 
 
 
354 aa  149  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  36.34 
 
 
324 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  36.31 
 
 
317 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  34.24 
 
 
329 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  36.58 
 
 
322 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40880  agmatinase  32.48 
 
 
416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>