More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3103 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3103  agmatinase  100 
 
 		 323 aa  659    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0277  agmatinase  66.25 
 
 		 322 aa  414  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17372 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1578  agmatinase  39.87 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1151  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38.89 
 
 		 329 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_004310  BR1957  arginase family protein  37.29 
 
 		 337 aa  206  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2732  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  37.46 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.167247  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1883  arginase family protein  36.96 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2290  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  37.54 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1098  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  37.33 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.680676  normal  0.149634 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4509  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  37.79 
 
 		 323 aa  198  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1954  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  41.67 
 
 		 303 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2237  agmatinase  38.95 
 
 		 303 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.972034  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1777  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  39.58 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  0.0243796 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  37.19 
 
 		 311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  37.67 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  38.49 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  38.24 
 
 		 322 aa  178  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  39.53 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  37.54 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  38.67 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  38.61 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  39.16 
 
 		 317 aa  176  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  39.07 
 
 		 330 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  39.43 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  38.83 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  38.83 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  37.66 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  38.83 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  38.83 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  38.83 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  37.66 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  36.45 
 
 		 316 aa  173  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  39.43 
 
 		 329 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  37.92 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  37.92 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  37.92 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  35.91 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  37.86 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  39.64 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  40.07 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  39.14 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  37.58 
 
 		 318 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  39.09 
 
 		 322 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  39.07 
 
 		 354 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  38.46 
 
 		 318 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  39.07 
 
 		 354 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  36.21 
 
 		 319 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  36.21 
 
 		 319 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  37.75 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  37.25 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  36.07 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  36.07 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  38.93 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  36.69 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  34.16 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  35.58 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  37.9 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  36.07 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  36.07 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  36.84 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  36 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  35.76 
 
 		 345 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  35.76 
 
 		 345 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  37.34 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  37.34 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  37.34 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  34.67 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  36.36 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  34.81 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  34.81 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  36.19 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  38.1 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  35.44 
 
 		 345 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0094  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.33 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  36.79 
 
 		 318 aa  162  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  31.23 
 
 		 351 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  36.16 
 
 		 318 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  34.81 
 
 		 340 aa  162  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  38.38 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  34.17 
 
 		 356 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  37.34 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0814  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.55 
 
 		 385 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.237989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  38.21 
 
 		 316 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  38.11 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  37.34 
 
 		 324 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  37.46 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  35.31 
 
 		 310 aa  159  6e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  31.36 
 
 		 297 aa  159  8e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  35.84 
 
 		 319 aa  159  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  32.39 
 
 		 396 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2025  agmatinase  32.71 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.298316  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  35.39 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  34.58 
 
 		 316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4275  agmatinase  36.39 
 
 		 321 aa  155  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  35.49 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  36.36 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  33.63 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  37.1 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  37.1 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  37.1 
 
 		 321 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>