More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1151 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1151  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 		 329 aa  666    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_004310  BR1957  arginase family protein  86.77 
 
 		 337 aa  575  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1883  arginase family protein  85.85 
 
 		 337 aa  566  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1578  agmatinase  62.42 
 
 		 318 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4509  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  62.54 
 
 		 323 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2237  agmatinase  43.31 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.972034  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1777  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  44.57 
 
 		 303 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  0.0243796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1954  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  44.57 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3103  agmatinase  38.89 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0277  agmatinase  37.46 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17372 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2290  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.67 
 
 		 312 aa  169  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1098  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.54 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.680676  normal  0.149634 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2732  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.04 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.167247  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  33.22 
 
 		 319 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  31.23 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  30 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  29.68 
 
 		 319 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  31.05 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  31.45 
 
 		 329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  30.82 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  28.81 
 
 		 315 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  29.14 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0545  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.72 
 
 		 332 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  31.06 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  32.62 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  32.08 
 
 		 322 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  30.58 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  31.29 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  31.1 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  29.08 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  31.63 
 
 		 354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  31.12 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  31.63 
 
 		 354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  29.72 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  31.29 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  32.75 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  29.18 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0557  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.72 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.30365e-16 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  29.72 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  30.79 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  29.72 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  29.72 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  28.67 
 
 		 319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  30.95 
 
 		 318 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  31.14 
 
 		 317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  34.36 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  31.5 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  29.9 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  31.5 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  28.98 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  31.5 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  33.22 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  31.5 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  31.5 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  31.5 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  29.9 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  32.07 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  29.9 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  30.61 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  33.92 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  30.16 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  31.47 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  31.96 
 
 		 315 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  30.54 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  30.63 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  29.58 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  37.96 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  31.82 
 
 		 327 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  34.77 
 
 		 345 aa  109  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  31.14 
 
 		 305 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  30 
 
 		 306 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  33.94 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2118  agmatinase  31.71 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  30 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  32.63 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  31.1 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  27.9 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  30.07 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  30.07 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  30.07 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  29.55 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  31.1 
 
 		 324 aa  105  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  32.07 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  28.57 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  27.44 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  32.58 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  30 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  28.82 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  28.8 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  27.76 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  29.33 
 
 		 307 aa  104  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  29.61 
 
 		 345 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  29.61 
 
 		 345 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  28.28 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  29.12 
 
 		 378 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  29.61 
 
 		 345 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  29.07 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  29.17 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  33.46 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.92 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>