More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0557 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0557  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 		 332 aa  684    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.30365e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0545  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  97.89 
 
 		 332 aa  677    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2353  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  71.38 
 
 		 341 aa  509  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0743  agmatinase  28.26 
 
 		 401 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  28.84 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5245  Agmatinase  30.57 
 
 		 396 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0094  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28 
 
 		 382 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  28.16 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  27.74 
 
 		 315 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0814  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.71 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.237989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  30.34 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40880  agmatinase  29.28 
 
 		 416 aa  126  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  29.08 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  30.24 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  29.74 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  30.13 
 
 		 356 aa  122  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  29.5 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  29.81 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4275  agmatinase  29.43 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  29.5 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  28.72 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  28.72 
 
 		 318 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  29.45 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  28.72 
 
 		 354 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  28.72 
 
 		 354 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  28.99 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  28.99 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  28.99 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4832  agmatinase  27.8 
 
 		 378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0848  agmatinase  28.57 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  28.99 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  28.99 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  28.44 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  28.39 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  28.38 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2025  agmatinase  29.13 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.298316  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1151  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.72 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  27.85 
 
 		 324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  28.38 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  28.38 
 
 		 329 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  27.44 
 
 		 369 aa  116  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  28.66 
 
 		 317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  28.21 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  27.94 
 
 		 369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4346  Agmatinase  29.45 
 
 		 478 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  28.01 
 
 		 317 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3224  agmatinase  28.91 
 
 		 333 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  27.78 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  25.78 
 
 		 365 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  29.51 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1784  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.75 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  27.53 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  27.8 
 
 		 340 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  25.97 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  26.05 
 
 		 310 aa  109  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  28.71 
 
 		 322 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  28.57 
 
 		 320 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  27.36 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1098  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.52 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.680676  normal  0.149634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  26.01 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  26.01 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1957  arginase family protein  30.9 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1883  arginase family protein  30.9 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  27.36 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3103  agmatinase  29.86 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  26.51 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  28.48 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1967  agmatinase  27.85 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0638038  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  26.23 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  25.94 
 
 		 316 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  27.27 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  25.86 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  27.97 
 
 		 319 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  28.19 
 
 		 330 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  27.97 
 
 		 319 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  27.97 
 
 		 319 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2290  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.99 
 
 		 312 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  26.51 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  28.99 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  26.15 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  27.02 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  27.02 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  28.43 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3351  formimidoylglutamase  28.3 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  26.54 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  29.14 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  28.25 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1743  agmatinase  29.15 
 
 		 346 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3439  formimidoylglutamase  28.3 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3709  formimidoylglutamase  28.3 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3659  formimidoylglutamase  28.3 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  26.86 
 
 		 320 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  26.86 
 
 		 320 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  26.86 
 
 		 316 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  27.12 
 
 		 315 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  28.47 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  26.86 
 
 		 320 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1890  agmatinase  29.11 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0474276 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  29.79 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  28.74 
 
 		 321 aa  102  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>