More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2353 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2353  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 
341 aa  701    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0545  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  71.69 
 
 
332 aa  511  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0557  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  71.38 
 
 
332 aa  509  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.30365e-16 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0094  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.96 
 
 
382 aa  135  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284033  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0814  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.35 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.237989  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0743  agmatinase  27.86 
 
 
401 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618135  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  29.35 
 
 
346 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  29.58 
 
 
322 aa  129  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  29.49 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  30.39 
 
 
356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  28.57 
 
 
324 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  29.93 
 
 
333 aa  126  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4275  agmatinase  30.66 
 
 
321 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5245  Agmatinase  28.71 
 
 
396 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  28.24 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40880  agmatinase  29.06 
 
 
416 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  29.68 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3224  agmatinase  29.43 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  27.78 
 
 
369 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  28.08 
 
 
318 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4346  Agmatinase  31.06 
 
 
478 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2025  agmatinase  29.13 
 
 
353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.298316  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  32.29 
 
 
351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  29.02 
 
 
322 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0848  agmatinase  26.62 
 
 
340 aa  116  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384974  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  29.77 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  27.44 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  29.08 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  29.08 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  29.27 
 
 
324 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  27.96 
 
 
345 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  29.89 
 
 
369 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.56 
 
 
335 aa  113  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  28.72 
 
 
316 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  25.65 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  26.3 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4832  agmatinase  25.78 
 
 
378 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  25.48 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3336  formimidoylglutamase  29.24 
 
 
323 aa  109  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.301376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3757  formimidoylglutamase  29.6 
 
 
323 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  29.66 
 
 
311 aa  109  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  28.82 
 
 
337 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3351  formimidoylglutamase  29.24 
 
 
323 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  29.34 
 
 
351 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  28.93 
 
 
317 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  28.88 
 
 
323 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  26.76 
 
 
316 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  25.97 
 
 
320 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  26.46 
 
 
340 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  28.28 
 
 
318 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  28.91 
 
 
319 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  27.62 
 
 
330 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  29.43 
 
 
315 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  25.16 
 
 
365 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  25.16 
 
 
365 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  28.12 
 
 
321 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3439  formimidoylglutamase  28.88 
 
 
323 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3709  formimidoylglutamase  28.88 
 
 
323 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3659  formimidoylglutamase  28.88 
 
 
323 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3682  formimidoylglutamase  28.52 
 
 
323 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1559  formimidoylglutamase  28.73 
 
 
323 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459006  normal  0.0875298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  27 
 
 
334 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  24.84 
 
 
365 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  28.47 
 
 
325 aa  106  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  29.39 
 
 
321 aa  105  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3869  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.86 
 
 
321 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  28.03 
 
 
319 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3402  formimidoylglutamase  28.16 
 
 
323 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.786826  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  27.68 
 
 
318 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  28.03 
 
 
319 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  25.16 
 
 
327 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  28.03 
 
 
319 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  27.3 
 
 
315 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  27.61 
 
 
318 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  27.93 
 
 
354 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  27.68 
 
 
329 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  27.93 
 
 
354 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  27.21 
 
 
322 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  27.68 
 
 
318 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3103  agmatinase  27.08 
 
 
323 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  28.68 
 
 
326 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  28.68 
 
 
326 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  28.68 
 
 
326 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  30.07 
 
 
356 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1784  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.81 
 
 
334 aa  102  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  25.86 
 
 
338 aa  102  8e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  25.24 
 
 
316 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  26.71 
 
 
354 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3988  agmatinase  27.76 
 
 
331 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0861741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  26.86 
 
 
317 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  25.87 
 
 
329 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  27.76 
 
 
324 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  27.08 
 
 
320 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  27.08 
 
 
320 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  27.27 
 
 
315 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  27.08 
 
 
320 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  26.3 
 
 
342 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3024  putative agmatinase  26.84 
 
 
354 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197883  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  27.08 
 
 
316 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0990  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.72 
 
 
336 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>