More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0743 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0743  agmatinase  100 
 
 
401 aa  828    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618135  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40880  agmatinase  70.6 
 
 
416 aa  573  1.0000000000000001e-162  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  65.77 
 
 
396 aa  514  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5245  Agmatinase  66.39 
 
 
396 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0814  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  59.36 
 
 
385 aa  463  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.237989  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0094  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  58.4 
 
 
382 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284033  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  36.67 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  36.67 
 
 
317 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  34.5 
 
 
315 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  33.97 
 
 
315 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  35.56 
 
 
322 aa  179  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  32.82 
 
 
340 aa  176  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  34.44 
 
 
319 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  34.44 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  33.96 
 
 
345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  33.96 
 
 
345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  33.96 
 
 
345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  34.77 
 
 
310 aa  172  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2473  agmatinase  35.56 
 
 
351 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4832  agmatinase  34.64 
 
 
378 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  35.43 
 
 
318 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  33.44 
 
 
320 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3224  agmatinase  35.74 
 
 
333 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  36.01 
 
 
310 aa  171  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  33.77 
 
 
319 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  34.67 
 
 
319 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  34.67 
 
 
319 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  34.67 
 
 
319 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  34.26 
 
 
315 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  36.09 
 
 
334 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  33.22 
 
 
326 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  32.46 
 
 
316 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  33.22 
 
 
354 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  33.22 
 
 
326 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  33.22 
 
 
326 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  33.33 
 
 
321 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  36.16 
 
 
316 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  35.48 
 
 
365 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  34.09 
 
 
324 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  35.48 
 
 
365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  35.48 
 
 
365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  33.33 
 
 
337 aa  166  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  30.94 
 
 
327 aa  166  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  31.17 
 
 
324 aa  166  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4275  agmatinase  35.53 
 
 
321 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  32.8 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  31.8 
 
 
316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0848  agmatinase  33.12 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384974  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  33.23 
 
 
329 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  34.43 
 
 
329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  34.09 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  35.11 
 
 
351 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  34.33 
 
 
319 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  33.44 
 
 
305 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  32.78 
 
 
320 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  33.77 
 
 
318 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  32.78 
 
 
320 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  33.22 
 
 
317 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  31.58 
 
 
378 aa  163  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  33.44 
 
 
354 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  33.77 
 
 
318 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  33.44 
 
 
354 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  32.78 
 
 
316 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  33.89 
 
 
329 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  33.44 
 
 
316 aa  162  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  33.23 
 
 
345 aa  162  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  33.55 
 
 
318 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  32.78 
 
 
320 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  32.33 
 
 
333 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  33.89 
 
 
342 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  33.77 
 
 
318 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  33.77 
 
 
315 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  32.79 
 
 
324 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6439  agmatinase  35.11 
 
 
351 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0137522 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  34.98 
 
 
325 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  33.55 
 
 
315 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1784  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.01 
 
 
334 aa  160  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  33.76 
 
 
330 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2410  putative agmatinase  35.56 
 
 
352 aa  160  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.377462  normal  0.11996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  32.91 
 
 
369 aa  159  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  33.11 
 
 
318 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  32.05 
 
 
324 aa  159  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  33.55 
 
 
317 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6964  agmatinase  34.65 
 
 
334 aa  159  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  33.55 
 
 
317 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  33.55 
 
 
317 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  31.27 
 
 
346 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  33.55 
 
 
317 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  33.55 
 
 
317 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3024  putative agmatinase  34.52 
 
 
354 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197883  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  33.11 
 
 
318 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  34.85 
 
 
318 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  33.22 
 
 
317 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  32.45 
 
 
316 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  32.57 
 
 
325 aa  158  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0990  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.03 
 
 
336 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  34.74 
 
 
356 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  32.8 
 
 
345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  32.8 
 
 
343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  32.8 
 
 
343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>