More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1825 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  98.63 
 
 
365 aa  724    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  100 
 
 
365 aa  734    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  100 
 
 
365 aa  734    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1743  agmatinase  72.42 
 
 
346 aa  454  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3224  agmatinase  69.58 
 
 
333 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  65.06 
 
 
356 aa  428  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  49.04 
 
 
369 aa  289  7e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  47.85 
 
 
346 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0848  agmatinase  47.92 
 
 
340 aa  285  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384974  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4832  agmatinase  46.48 
 
 
378 aa  281  9e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  47.6 
 
 
340 aa  279  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  50 
 
 
345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  50 
 
 
345 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  50 
 
 
345 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3024  putative agmatinase  46.25 
 
 
354 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197883  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4346  Agmatinase  40.85 
 
 
478 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4275  agmatinase  42.58 
 
 
321 aa  225  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  40.26 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  39.87 
 
 
318 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  38.96 
 
 
316 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  40 
 
 
325 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  40.52 
 
 
324 aa  193  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  39.94 
 
 
321 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  40.07 
 
 
319 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  41.67 
 
 
317 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  41.67 
 
 
317 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  41.67 
 
 
317 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  41.86 
 
 
317 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  41.67 
 
 
317 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  41.67 
 
 
317 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  40.07 
 
 
319 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  40.07 
 
 
319 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  39.23 
 
 
320 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  39.24 
 
 
316 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  37.91 
 
 
354 aa  189  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  39.24 
 
 
320 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  40.75 
 
 
320 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  40.75 
 
 
320 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  38.89 
 
 
318 aa  189  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  40.14 
 
 
319 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  39.22 
 
 
318 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  40 
 
 
319 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  38.26 
 
 
329 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  38.56 
 
 
318 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  38.56 
 
 
354 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  38.56 
 
 
329 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  38.56 
 
 
354 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  38.56 
 
 
318 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  38.16 
 
 
327 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  35.41 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  39.87 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  38.31 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  37.58 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  38.78 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  38.26 
 
 
315 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  38.56 
 
 
329 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  39.62 
 
 
315 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5245  Agmatinase  35.74 
 
 
396 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  37.82 
 
 
315 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  39.42 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  39.04 
 
 
322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  40.43 
 
 
337 aa  180  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  41.1 
 
 
318 aa  180  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  38.24 
 
 
342 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  39.19 
 
 
318 aa  179  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  38.71 
 
 
316 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  38.96 
 
 
310 aa  178  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  40.83 
 
 
326 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  40.83 
 
 
326 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  37.66 
 
 
319 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  40.83 
 
 
326 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  40.07 
 
 
321 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  38.17 
 
 
324 aa  177  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  36.01 
 
 
315 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  40.48 
 
 
369 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  40.14 
 
 
345 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  36.76 
 
 
315 aa  177  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  39.29 
 
 
306 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  40.75 
 
 
345 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  40.75 
 
 
343 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  40.75 
 
 
343 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  38.68 
 
 
333 aa  176  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40880  agmatinase  35.74 
 
 
416 aa  176  8e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  39.12 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  35.51 
 
 
315 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  37.46 
 
 
324 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  33.44 
 
 
318 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0094  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.5 
 
 
382 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284033  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  39.43 
 
 
313 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  38.01 
 
 
320 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  39.43 
 
 
313 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  39.43 
 
 
313 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  33.97 
 
 
305 aa  170  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  38.29 
 
 
317 aa  170  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  38.49 
 
 
322 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  36.91 
 
 
310 aa  169  8e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0814  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.6 
 
 
385 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.237989  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7678  agmatinase  38.54 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00557862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0743  agmatinase  35.74 
 
 
401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618135  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  37.34 
 
 
318 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>