More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1743 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1743  agmatinase  100 
 
 		 346 aa  693    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3224  agmatinase  78.64 
 
 		 333 aa  501  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  71.99 
 
 		 365 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  72.73 
 
 		 365 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  71.99 
 
 		 365 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  65.28 
 
 		 356 aa  434  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  54.08 
 
 		 369 aa  293  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  51.84 
 
 		 340 aa  290  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4832  agmatinase  51.15 
 
 		 378 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  46.47 
 
 		 346 aa  287  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0848  agmatinase  51.7 
 
 		 340 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  53.93 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  53.93 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  53.57 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3024  putative agmatinase  53.51 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197883  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4346  Agmatinase  42.33 
 
 		 478 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4275  agmatinase  45.85 
 
 		 321 aa  236  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  41.67 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  41.67 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  41.67 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  41.67 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  41.67 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  39.31 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  39.31 
 
 		 329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  42.86 
 
 		 319 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  42.86 
 
 		 319 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  42.86 
 
 		 319 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  41.33 
 
 		 317 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  38.97 
 
 		 318 aa  189  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  39.53 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  38.97 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  38.28 
 
 		 354 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  38.28 
 
 		 354 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  38.28 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  40.51 
 
 		 325 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  39.55 
 
 		 329 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  42.18 
 
 		 318 aa  186  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  38.46 
 
 		 315 aa  186  7e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  40.8 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  40.14 
 
 		 319 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5245  Agmatinase  35.03 
 
 		 396 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  41.1 
 
 		 327 aa  182  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  34.35 
 
 		 396 aa  181  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  39.2 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  41.18 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  36.89 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  37.22 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  41.44 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  38.75 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1433  putative agmatinase  43.2 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  41.11 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  37.46 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  37.5 
 
 		 319 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  37.46 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  40.14 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  37.16 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  38.89 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  37.46 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  38.64 
 
 		 322 aa  177  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  37.46 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  38.49 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  37.07 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40880  agmatinase  36.62 
 
 		 416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  37.72 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  39.02 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  37.67 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  38.87 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  39.12 
 
 		 318 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  39.12 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  37.33 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0094  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.56 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  38.83 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  37.93 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  38.31 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  40 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  39.38 
 
 		 369 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  36.93 
 
 		 378 aa  170  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  40 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  37.46 
 
 		 315 aa  170  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  39.04 
 
 		 345 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0814  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.23 
 
 		 385 aa  170  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.237989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  37.07 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  39.93 
 
 		 326 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  39.93 
 
 		 326 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  39.93 
 
 		 326 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  35.82 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3040  agmatinase  40.69 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301335  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3024  agmatinase  40.69 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3083  agmatinase  40.69 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  38.24 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  35.88 
 
 		 319 aa  168  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  39.16 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  41.08 
 
 		 345 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  35.99 
 
 		 324 aa  165  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  41.08 
 
 		 343 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  41.08 
 
 		 343 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  35.83 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  36.99 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0743  agmatinase  35.34 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  37.92 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>