More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2324 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2324  arginase  100 
 
 		 296 aa  588  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  92.91 
 
 		 303 aa  555  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  53.58 
 
 		 306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  54.27 
 
 		 298 aa  302  6.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  52.01 
 
 		 298 aa  293  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  51.53 
 
 		 299 aa  282  6.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  51.19 
 
 		 299 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  49.67 
 
 		 301 aa  279  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  48.47 
 
 		 298 aa  275  8e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  48.18 
 
 		 315 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  46.28 
 
 		 297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  46.62 
 
 		 297 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  46.62 
 
 		 297 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  46.62 
 
 		 297 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  46.28 
 
 		 297 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  47.47 
 
 		 300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  46.28 
 
 		 297 aa  269  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  46.62 
 
 		 297 aa  269  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  46.62 
 
 		 297 aa  269  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  45.95 
 
 		 297 aa  267  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  45.95 
 
 		 297 aa  267  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  45.61 
 
 		 297 aa  266  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  46.96 
 
 		 299 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  47.83 
 
 		 302 aa  262  4.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  47.1 
 
 		 297 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  46.41 
 
 		 302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  46.36 
 
 		 301 aa  251  9.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  44.88 
 
 		 299 aa  245  8e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  46.1 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  42.28 
 
 		 302 aa  241  7.999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  42.28 
 
 		 302 aa  241  7.999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  44.78 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  45.64 
 
 		 310 aa  238  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  44.11 
 
 		 308 aa  235  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  44.41 
 
 		 351 aa  235  6e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  44 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  44.97 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  43.33 
 
 		 311 aa  232  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  43.62 
 
 		 321 aa  231  9e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  43.19 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  45.03 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  43.19 
 
 		 304 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  42.86 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  46.86 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  44.48 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  43.85 
 
 		 341 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  41.86 
 
 		 305 aa  225  7e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  46.15 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  43.05 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  43 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  45 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  42.33 
 
 		 328 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  42.11 
 
 		 328 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  45.15 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  45.03 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  44.7 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  41.25 
 
 		 308 aa  218  8.999999999999998e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  41.33 
 
 		 307 aa  218  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  42.76 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  43.01 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  40.46 
 
 		 310 aa  215  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  42.76 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  42.76 
 
 		 325 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  41.75 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  42.76 
 
 		 306 aa  211  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  41.58 
 
 		 326 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  40.89 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  38.72 
 
 		 304 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  42.38 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  40.92 
 
 		 318 aa  202  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  36.93 
 
 		 309 aa  199  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  37.83 
 
 		 306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  39.02 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  37.5 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  37.17 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  38.82 
 
 		 309 aa  192  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  41.12 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  41.12 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  41.12 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  37.05 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  32.36 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  35.03 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.86 
 
 		 309 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  36.16 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.46 
 
 		 316 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  33.45 
 
 		 309 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  39.72 
 
 		 301 aa  132  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  31.45 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.69 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.33 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  32.74 
 
 		 314 aa  125  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.01 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.47 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.8 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.65 
 
 		 335 aa  95.9  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  29.72 
 
 		 323 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3439  formimidoylglutamase  30 
 
 		 323 aa  95.9  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3709  formimidoylglutamase  30 
 
 		 323 aa  95.9  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3659  formimidoylglutamase  30 
 
 		 323 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3351  formimidoylglutamase  29.6 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>