More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4603 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4603  arginase  100 
 
 
304 aa  622  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  86.51 
 
 
305 aa  549  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  78 
 
 
311 aa  479  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  73.24 
 
 
321 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  71.67 
 
 
310 aa  450  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  74.47 
 
 
282 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  71.48 
 
 
341 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  67.11 
 
 
304 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  66.56 
 
 
307 aa  414  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  67.22 
 
 
306 aa  417  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  66.11 
 
 
306 aa  412  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  65.78 
 
 
306 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  66.11 
 
 
302 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  67.22 
 
 
307 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  63.73 
 
 
319 aa  391  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  62.38 
 
 
321 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  48.84 
 
 
307 aa  269  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  48.18 
 
 
308 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  48.18 
 
 
308 aa  268  7e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  47.33 
 
 
309 aa  265  7e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  46.03 
 
 
315 aa  259  5.0000000000000005e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  44.85 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  47.73 
 
 
324 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  46.56 
 
 
311 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  46.1 
 
 
311 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  47.39 
 
 
318 aa  246  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  47.37 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  45.85 
 
 
299 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  43.48 
 
 
301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  42.72 
 
 
299 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  42.52 
 
 
300 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  44.16 
 
 
326 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  44.34 
 
 
331 aa  237  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  42.86 
 
 
298 aa  237  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  43.85 
 
 
303 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  46.67 
 
 
310 aa  235  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  44.9 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  44.16 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  45.39 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  45.28 
 
 
328 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  43.75 
 
 
299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  44.85 
 
 
302 aa  232  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  43.38 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  40.8 
 
 
297 aa  229  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  43.19 
 
 
296 aa  229  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  44.59 
 
 
308 aa  228  7e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  40.47 
 
 
297 aa  228  9e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  40.47 
 
 
297 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  43.83 
 
 
309 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  40.47 
 
 
297 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  40.47 
 
 
297 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  40.47 
 
 
297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  44.12 
 
 
309 aa  225  9e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  40.13 
 
 
297 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  42.14 
 
 
299 aa  224  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  40.13 
 
 
297 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  40.13 
 
 
297 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  43.48 
 
 
308 aa  223  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  40.13 
 
 
297 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  41.08 
 
 
297 aa  222  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  42.43 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  39.13 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  43.97 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  42.95 
 
 
306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  36.07 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  41.37 
 
 
298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  36.07 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  42.11 
 
 
306 aa  220  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  40.32 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  40.97 
 
 
301 aa  209  5e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  39.62 
 
 
306 aa  206  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  43.42 
 
 
309 aa  206  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2047  arginase  44.82 
 
 
306 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.657503  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  43.93 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  41.56 
 
 
308 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  37.22 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  41.56 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  41.23 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  36.39 
 
 
351 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  36.36 
 
 
301 aa  172  5.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  37.55 
 
 
324 aa  166  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  33.45 
 
 
317 aa  157  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  33.02 
 
 
398 aa  156  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  34.3 
 
 
309 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.22 
 
 
309 aa  149  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.16 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.54 
 
 
315 aa  145  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.25 
 
 
316 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  34.69 
 
 
301 aa  139  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  31.53 
 
 
306 aa  129  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.85 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.75 
 
 
309 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  27.13 
 
 
314 aa  119  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.25 
 
 
319 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.71 
 
 
335 aa  95.9  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  26.37 
 
 
396 aa  93.6  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2768  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.37 
 
 
298 aa  92.8  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  29.61 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1784  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.25 
 
 
334 aa  90.9  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5245  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.75 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341043  normal  0.463568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>