128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0213 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0213  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 		 362 aa  713    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0221  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  96.46 
 
 		 330 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1926  Arginase/agmatinase/formimino glutamase  40.34 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1296  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.81 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.925134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3987  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38.49 
 
 		 395 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3606  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.78 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0938214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4687  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.12 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5245  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38.51 
 
 		 307 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341043  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8299  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  40.34 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2768  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  39.14 
 
 		 298 aa  136  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2669  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.77 
 
 		 301 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0909707  normal  0.34784 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0654  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.99 
 
 		 310 aa  92.8  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  32.89 
 
 		 299 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  32.21 
 
 		 299 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  33.33 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  31.53 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  32.84 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  27.91 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  29.92 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  29.92 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  29.92 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  29.92 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  31.1 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  29.53 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  29.92 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.08 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  25.51 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  25.51 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  28.82 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  29.55 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  29.55 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  28.14 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  29.17 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  29.17 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  29.17 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  28.81 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  29.15 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  32.09 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  31.82 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  33.51 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  24.48 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  29.15 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  29.44 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  28.71 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2852  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.35 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  28.38 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  27.48 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  30.16 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  27.23 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  29.29 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  27.38 
 
 		 301 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.7 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  32.61 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  29.39 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  29.39 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  24.59 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  26.6 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  29.01 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  27.88 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  30.09 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  31.58 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  31.58 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1433  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.04 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0455111  normal  0.0134967 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1559  formimidoylglutamase  24.49 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459006  normal  0.0875298 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  25.93 
 
 		 282 aa  57  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3439  formimidoylglutamase  24.87 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3351  formimidoylglutamase  24.87 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3709  formimidoylglutamase  24.87 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2584  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.28 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.704538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3757  formimidoylglutamase  24.17 
 
 		 323 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3659  formimidoylglutamase  24.87 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  28.1 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  26.45 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  27.74 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  28.24 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  30.43 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3402  formimidoylglutamase  24.02 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.786826  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5626  Arginase/agmatinase/formimino glutamase  29.74 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  decreased coverage  0.00341242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  24.58 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3336  formimidoylglutamase  24.37 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.301376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1264  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.55 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3682  formimidoylglutamase  24.02 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  23.76 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  27.42 
 
 		 307 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  26.17 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.07 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1365  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.08 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  30.3 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  22.98 
 
 		 319 aa  53.1  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2309  formimidoylglutamase  25.37 
 
 		 322 aa  53.1  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1151  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.48 
 
 		 329 aa  52.8  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  29.46 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  33.49 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1275  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.73 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  27.33 
 
 		 341 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1957  arginase family protein  27.78 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1883  arginase family protein  27.78 
 
 		 337 aa  50.4  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  26.55 
 
 		 301 aa  50.1  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  30.62 
 
 		 306 aa  49.7  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  25.85 
 
 		 310 aa  49.7  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>