127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2852 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2852  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 
337 aa  674    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1433  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  86.25 
 
 
291 aa  504  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0455111  normal  0.0134967 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  32.18 
 
 
298 aa  98.6  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  33.53 
 
 
300 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  30.88 
 
 
302 aa  93.2  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5626  Arginase/agmatinase/formimino glutamase  32.09 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  decreased coverage  0.00341242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  31.19 
 
 
299 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  31.94 
 
 
307 aa  88.6  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  34.63 
 
 
301 aa  88.2  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  29.81 
 
 
315 aa  87  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  32.73 
 
 
328 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  30.77 
 
 
299 aa  86.3  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.13 
 
 
315 aa  85.9  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.84 
 
 
316 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  33.04 
 
 
299 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  29.35 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  32.84 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  35.34 
 
 
297 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  35.34 
 
 
297 aa  84  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  35.34 
 
 
297 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  35.34 
 
 
297 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  25.35 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  35.34 
 
 
297 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  35.34 
 
 
297 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  31.68 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  35.34 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  31.72 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  32.09 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  32.63 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  32.09 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  33.51 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  32.34 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  31.19 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1087  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.53 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  29.76 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  30.13 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  29.26 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  28.7 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  33.33 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.14 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  29.35 
 
 
305 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  29.38 
 
 
311 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  33.62 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  31.05 
 
 
327 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  28.96 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  31.84 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  28.86 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  31.46 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  28.86 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  31.46 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  32.81 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  29.11 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  28.42 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  30.16 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  34.91 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  28.16 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  27.27 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1162  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  29.11 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  28.42 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  27.73 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  33.16 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  23.55 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  23.55 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  26.91 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  27.88 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2813  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.44 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.233538  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  27.88 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  27.23 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  30.73 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  27.96 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  24.6 
 
 
324 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  27.8 
 
 
303 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  30.16 
 
 
309 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  28.71 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  28.51 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  26.53 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  27.72 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  28.37 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  29.21 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  29.58 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  27.8 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.88 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  25.47 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  30.94 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.77 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4425  Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase arginase family-like protein  33.71 
 
 
477 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  29.33 
 
 
321 aa  67  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.87 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  28.23 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09260  arginase family hydrolase, arginase/agmainase/formiminoglutamate hydrolase  32.56 
 
 
277 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  28.34 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  35.97 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  30.81 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  30.81 
 
 
308 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  30.73 
 
 
322 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  26.51 
 
 
317 aa  62.8  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  27.01 
 
 
310 aa  62.8  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1296  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  23.17 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.925134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4687  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  20 
 
 
300 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>