109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1162 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1162  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 		 260 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1087  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  40.93 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2813  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  42.19 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.233538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5820  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  44.29 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.884227  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5626  Arginase/agmatinase/formimino glutamase  42.34 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  decreased coverage  0.00341242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  35.8 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  35.85 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  33.96 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2852  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38 
 
 		 337 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  27.13 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09260  arginase family hydrolase, arginase/agmainase/formiminoglutamate hydrolase  38.06 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  35.48 
 
 		 298 aa  72  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1433  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.01 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0455111  normal  0.0134967 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  28.8 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  32.28 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  27.59 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  33.53 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  27.59 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  27.59 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  28.69 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  27.5 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  28 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  27.5 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  27.5 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  28 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  29.11 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  29.11 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  26.63 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  32.41 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  33.54 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  33.74 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  32.67 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  28.75 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  29.9 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  33.13 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  33.13 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  33.74 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  28.66 
 
 		 301 aa  62  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  35.88 
 
 		 302 aa  62  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  32.7 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  31.84 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  32.3 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  34.88 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4425  Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase arginase family-like protein  30 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  30.67 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  31.29 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.99 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  34.33 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  24.63 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  24.63 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  30.05 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  32.12 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  27.23 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  30.72 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.04 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  33.14 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  28.57 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  30.34 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  32.03 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  31.29 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  28.87 
 
 		 328 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  29.01 
 
 		 307 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  32.04 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  31.71 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  33.73 
 
 		 322 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  30.06 
 
 		 321 aa  55.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  29.27 
 
 		 328 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  29.8 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  31.82 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  32.09 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  30.19 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  28.19 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  27.67 
 
 		 306 aa  53.5  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  31.29 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  32.61 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  28.11 
 
 		 301 aa  53.1  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  28.34 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  31.21 
 
 		 305 aa  52.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  28.48 
 
 		 301 aa  52.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  28.39 
 
 		 306 aa  52.4  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  31.34 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1543  arginase  29.93 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427369  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  29.73 
 
 		 351 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  30.3 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  31.34 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  32.58 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  31.01 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  29.09 
 
 		 319 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  29.88 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.63 
 
 		 316 aa  49.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  30.99 
 
 		 302 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  30.28 
 
 		 311 aa  49.7  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  31.54 
 
 		 309 aa  49.3  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  34.33 
 
 		 308 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  32.58 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  32.58 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  24.2 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  25.59 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1242  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  23.04 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  25.24 
 
 		 319 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>