291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09260 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_09260  arginase family hydrolase, arginase/agmainase/formiminoglutamate hydrolase  100 
 
 
277 aa  545  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4425  Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase arginase family-like protein  38.04 
 
 
477 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2212  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.19 
 
 
296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.276874  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0585  arginine deaminase  33.82 
 
 
297 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0540  arginase/agmatinase/formiminoglutamase family protein  34.18 
 
 
298 aa  106  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  36.45 
 
 
307 aa  89.4  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  37.57 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1543  arginase  35.32 
 
 
287 aa  87  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427369  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1242  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  22.39 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5626  Arginase/agmatinase/formimino glutamase  31.92 
 
 
270 aa  85.5  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  decreased coverage  0.00341242 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35 
 
 
309 aa  85.5  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  34.76 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  34.76 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  34.71 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  44.7 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  30.85 
 
 
297 aa  83.2  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  34.88 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  37.57 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  31.32 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  31.32 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  34.09 
 
 
297 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  37.04 
 
 
298 aa  82  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  35.96 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  34.09 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  34.78 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  33.52 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  33.52 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  33.9 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  34.09 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  34.09 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  34.09 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  34.8 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  34.09 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.33 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  34.09 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  35 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  34.09 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  34.09 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  34.12 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  33.33 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  35.79 
 
 
315 aa  79  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  36.69 
 
 
306 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1087  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.02 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  36.47 
 
 
351 aa  75.9  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  38.62 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  40.74 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  31.64 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1162  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38.06 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  39.26 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  31.47 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  33.92 
 
 
321 aa  73.2  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  37.08 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  37.08 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  33.7 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  32.94 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  37.64 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  32.96 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  34.41 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2813  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.53 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.233538  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  38.65 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  32.49 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  34.44 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  33.69 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  34.27 
 
 
325 aa  68.9  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  34.46 
 
 
307 aa  68.9  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  35.85 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  31.46 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  35.03 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  38.16 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  35.09 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  33.71 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  30.38 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  35.71 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  31.46 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2852  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.56 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  30.39 
 
 
398 aa  65.1  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  30.5 
 
 
314 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  33.88 
 
 
306 aa  63.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  33.88 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  32.22 
 
 
319 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  31.98 
 
 
311 aa  63.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  37.78 
 
 
322 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  33.95 
 
 
308 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  31.31 
 
 
324 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  37.23 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1433  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.98 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0455111  normal  0.0134967 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  32.24 
 
 
306 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  34.25 
 
 
309 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  31.35 
 
 
304 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  33.85 
 
 
315 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  36.75 
 
 
309 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  32.32 
 
 
338 aa  60.1  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1890  agmatinase  31.67 
 
 
315 aa  59.7  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0474276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  31.09 
 
 
285 aa  59.7  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  31.35 
 
 
310 aa  58.9  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  28.18 
 
 
317 aa  58.5  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.21 
 
 
309 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  32.67 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  33.9 
 
 
341 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  34.74 
 
 
325 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>