148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5245 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5245  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 		 307 aa  605  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341043  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2768  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  80.47 
 
 		 298 aa  467  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4687  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.98 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3606  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  39.13 
 
 		 389 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0938214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3987  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  37.5 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1296  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.37 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.925134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1926  Arginase/agmatinase/formimino glutamase  36.45 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0221  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38.96 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0654  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.33 
 
 		 310 aa  138  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0213  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38.51 
 
 		 362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8299  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.23 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2669  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.14 
 
 		 301 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0909707  normal  0.34784 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  27.36 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  27.36 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  30.32 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  28.67 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  30.36 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  30.58 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  30.29 
 
 		 306 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  30.22 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  31.58 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.2 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  30.13 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  31.54 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  27.9 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  30.2 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  30.2 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  28 
 
 		 297 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  27.64 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  28 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  27.64 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  28.24 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  28.24 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  25.49 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  27.64 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  27.64 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  27.64 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  27.88 
 
 		 306 aa  93.2  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  29.55 
 
 		 299 aa  92.8  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.9 
 
 		 315 aa  92.4  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  28.48 
 
 		 321 aa  92.4  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  29.55 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  27.18 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  27.76 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  24.75 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  23.84 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  28.72 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  28.99 
 
 		 311 aa  89.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  24.35 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  26.6 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  27.24 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  27.21 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  23.93 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  26.45 
 
 		 297 aa  85.9  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  28.69 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  25.98 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  28.45 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  24.3 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  28.66 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  27.95 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  24.9 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  30.43 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  29.49 
 
 		 351 aa  79  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  25 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  28.05 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  29.05 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  30.51 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.32 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  23.36 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  24.73 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  24.89 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  27.6 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.32 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  26.06 
 
 		 341 aa  72.4  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  22.81 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  27.93 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  25.4 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  24.78 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.44 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  26.59 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  24.51 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  26.74 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  24.83 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  24.83 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  26.33 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  26.39 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  25.21 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  23.43 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0447  arginase  24.05 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0352  arginase  25.1 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  25.32 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  24.58 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  23.31 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1168  arginase  25.76 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  0.154133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2632  arginase  25.76 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.537237  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1289  arginase  25.76 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.691286 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  23.48 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4425  Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase arginase family-like protein  28.64 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1165  arginase  26.02 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0259461 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  24.89 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>