120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0221 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0221  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 
330 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00735889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0213  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  96.46 
 
 
362 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1926  Arginase/agmatinase/formimino glutamase  40.46 
 
 
295 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1296  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.36 
 
 
305 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.925134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3987  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38.59 
 
 
395 aa  159  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3606  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38.26 
 
 
389 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0938214 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5245  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38.96 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341043  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4687  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.77 
 
 
300 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8299  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  40.34 
 
 
309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2768  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  39.79 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2669  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.82 
 
 
301 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0909707  normal  0.34784 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0654  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.23 
 
 
310 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  31.99 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  31.62 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  31.99 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  30.94 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  28 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  28.33 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  28.33 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  28.33 
 
 
297 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  28.33 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  31.21 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  28.33 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  31.1 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  29.39 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.92 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  25.57 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  25.57 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  27.99 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  27.99 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  28.7 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  27.55 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  27.21 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  27.21 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  30.73 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  28.38 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  28.38 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  28.72 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  27.85 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  26.85 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0069  arginase  34.04 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.844337  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  31.78 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  29.46 
 
 
306 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  23.86 
 
 
297 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  26.03 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  28.22 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  27.99 
 
 
307 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  29.78 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  29.78 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1215  arginase  32.75 
 
 
309 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  29.11 
 
 
309 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  27.52 
 
 
308 aa  59.3  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  25.7 
 
 
398 aa  59.3  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0203  arginase  30.93 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0843  arginase  30.64 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1559  formimidoylglutamase  25 
 
 
323 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459006  normal  0.0875298 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0900  arginase  30.64 
 
 
306 aa  57.8  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.731145  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.95 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3439  formimidoylglutamase  25.38 
 
 
323 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3351  formimidoylglutamase  25.38 
 
 
323 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3709  formimidoylglutamase  25.38 
 
 
323 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545495  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  27.47 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3659  formimidoylglutamase  25.38 
 
 
323 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3757  formimidoylglutamase  24.64 
 
 
323 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  27.87 
 
 
308 aa  56.6  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  27.51 
 
 
351 aa  56.2  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3336  formimidoylglutamase  24.87 
 
 
323 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.301376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  24.26 
 
 
323 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  29.39 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2309  formimidoylglutamase  25.87 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  30.58 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3402  formimidoylglutamase  24.02 
 
 
323 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.786826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3682  formimidoylglutamase  24.02 
 
 
323 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  30.27 
 
 
322 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2852  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.77 
 
 
337 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25 
 
 
316 aa  53.1  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2584  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.7 
 
 
341 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.704538  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  25.68 
 
 
319 aa  52.8  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5626  Arginase/agmatinase/formimino glutamase  29.23 
 
 
270 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  decreased coverage  0.00341242 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1264  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.41 
 
 
341 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  33.96 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1365  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.94 
 
 
341 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  21.77 
 
 
319 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1470  arginase  29.66 
 
 
306 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  25.67 
 
 
305 aa  50.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1433  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.45 
 
 
291 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0455111  normal  0.0134967 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1098  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.37 
 
 
305 aa  49.3  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.680676  normal  0.149634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  26.21 
 
 
345 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  26.21 
 
 
345 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  27.8 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1414  agmatinase  24.22 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000244509  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  26.46 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  27.27 
 
 
341 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1275  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.56 
 
 
343 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  25.56 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  27.27 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  26.33 
 
 
304 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  25.86 
 
 
345 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1151  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.67 
 
 
329 aa  47  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  25.38 
 
 
340 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>