More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5045 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  100 
 
 		 329 aa  652    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1591  formimidoylglutamase  66.67 
 
 		 316 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854602  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2388  formimidoylglutamase  62.78 
 
 		 315 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.770652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2795  formimidoylglutamase  61.49 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2046  formimidoylglutamase  58.31 
 
 		 322 aa  345  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55166  normal  0.477762 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4413  formimidoylglutamase  56.62 
 
 		 320 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.624184 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2645  formimidoylglutamase  56.83 
 
 		 325 aa  317  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2879  formimidoylglutamase  55.59 
 
 		 325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2473  formimidoylglutamase  55.27 
 
 		 325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23170  formimidoylglutamase  52.6 
 
 		 311 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000566858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1954  formimidoylglutamase  52.27 
 
 		 311 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0479136  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4072  formimidoylglutamase  51.3 
 
 		 311 aa  280  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1031  formimidoylglutamase  45.12 
 
 		 348 aa  276  5e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.454798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0706  formimidoylglutamase  44.48 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.979825  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0824  formimidoylglutamase  46.37 
 
 		 336 aa  262  4.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000103972  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1261  formimidoylglutamase  46.6 
 
 		 312 aa  242  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02074  formimidoylglutamase  42.09 
 
 		 345 aa  240  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003721  formiminoglutamase  43.04 
 
 		 336 aa  238  8e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0599  formimidoylglutamase  48.43 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00699527 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0852  formimidoylglutamase  45.78 
 
 		 313 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1933  formimidoylglutamase  40.96 
 
 		 363 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.541509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0883  formimidoylglutamase  45.45 
 
 		 313 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0915  formimidoylglutamase  45.45 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0938  formimidoylglutamase  45.13 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0824  formimidoylglutamase  45.45 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0764  formimidoylglutamase  38.54 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0746  formimidoylglutamase  38.54 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0849  formimidoylglutamase  38.72 
 
 		 358 aa  229  6e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322036 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03170  formiminoglutamase  46.2 
 
 		 317 aa  225  8e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02330  formimidoylglutamase  43.95 
 
 		 348 aa  219  7e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0379  formimidoylglutamase  45.22 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1018  formiminoglutamase  37.42 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30730  formiminoglutamase  45.65 
 
 		 329 aa  207  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2010  formiminoglutamase  39.94 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03130  probable arginase family protein  37.39 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1279  formiminoglutamase  36.63 
 
 		 325 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2157  formiminoglutamase  39.93 
 
 		 322 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1919  formimidoylglutamase  32.8 
 
 		 311 aa  159  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2402  formimidoylglutamase  31.96 
 
 		 311 aa  159  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2359  formimidoylglutamase  31.96 
 
 		 311 aa  159  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3735  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.1 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498261  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.87 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1481  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.35 
 
 		 267 aa  96.3  7e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.354652 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  25.47 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3351  formimidoylglutamase  25.47 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3757  formimidoylglutamase  25.84 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3439  formimidoylglutamase  25.47 
 
 		 323 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3709  formimidoylglutamase  25.47 
 
 		 323 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3659  formimidoylglutamase  25.47 
 
 		 323 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3402  formimidoylglutamase  25.09 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.786826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3682  formimidoylglutamase  25.09 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1559  formimidoylglutamase  25.09 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459006  normal  0.0875298 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3336  formimidoylglutamase  24.72 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.301376  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4042  formiminoglutamase  28.88 
 
 		 304 aa  86.3  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.954236  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3835  formiminoglutamase  30.29 
 
 		 328 aa  86.3  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2309  formimidoylglutamase  23.97 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2732  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.92 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.167247  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2290  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4106  formiminoglutamase  28.8 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  29.68 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  27.21 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1098  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.57 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.680676  normal  0.149634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  27.21 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  27.21 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  26.38 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  26.22 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  28.67 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3024  putative agmatinase  27.56 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197883  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  26.95 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  27.04 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0232  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.43 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  27.02 
 
 		 316 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  27.3 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  27.66 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  27.3 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  26.77 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  28.52 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  27.3 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  28.52 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1543  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.22 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0983244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  27.3 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  27.74 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  27.4 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  28.29 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  26.97 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  28.45 
 
 		 282 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.8 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4509  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.66 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  26.77 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  27.78 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  27.78 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  29.52 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  26.6 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  26.97 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  27.27 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  27.66 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  28.48 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  28.25 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  26.52 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  26.86 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>