More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4072 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4072  formimidoylglutamase  100 
 
 		 311 aa  624  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0706  formimidoylglutamase  51.52 
 
 		 344 aa  323  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.979825  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1954  formimidoylglutamase  55.74 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0479136  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23170  formimidoylglutamase  55.74 
 
 		 311 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000566858 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1031  formimidoylglutamase  52.66 
 
 		 348 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.454798  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2645  formimidoylglutamase  54.61 
 
 		 325 aa  298  6e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2795  formimidoylglutamase  53.27 
 
 		 315 aa  291  7e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2879  formimidoylglutamase  51.48 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2473  formimidoylglutamase  51.48 
 
 		 325 aa  288  7e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2388  formimidoylglutamase  52.61 
 
 		 315 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.770652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02074  formimidoylglutamase  49.84 
 
 		 345 aa  282  5.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0824  formimidoylglutamase  51.11 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000103972  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  51.3 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003721  formiminoglutamase  48.56 
 
 		 336 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1591  formimidoylglutamase  52.98 
 
 		 316 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854602  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2046  formimidoylglutamase  49.21 
 
 		 322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55166  normal  0.477762 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0599  formimidoylglutamase  49.52 
 
 		 325 aa  255  9e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00699527 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0849  formimidoylglutamase  44.55 
 
 		 358 aa  252  5.000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322036 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1933  formimidoylglutamase  43.53 
 
 		 363 aa  241  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.541509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02330  formimidoylglutamase  45.23 
 
 		 348 aa  239  4e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4413  formimidoylglutamase  47.67 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.624184 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1261  formimidoylglutamase  49.83 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0883  formimidoylglutamase  47.35 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0915  formimidoylglutamase  47.35 
 
 		 313 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0824  formimidoylglutamase  47.35 
 
 		 313 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0852  formimidoylglutamase  47.02 
 
 		 313 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0938  formimidoylglutamase  47.02 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2010  formiminoglutamase  41.99 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30730  formiminoglutamase  47.76 
 
 		 329 aa  219  5e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1018  formiminoglutamase  41.07 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0379  formimidoylglutamase  46.15 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0764  formimidoylglutamase  38.94 
 
 		 319 aa  215  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03130  probable arginase family protein  40.8 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1279  formiminoglutamase  43.05 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0746  formimidoylglutamase  38.61 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03170  formiminoglutamase  45.9 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2157  formiminoglutamase  43.71 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1919  formimidoylglutamase  33.33 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2402  formimidoylglutamase  32.35 
 
 		 311 aa  155  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2359  formimidoylglutamase  32.35 
 
 		 311 aa  155  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3439  formimidoylglutamase  29.7 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3351  formimidoylglutamase  29.7 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3709  formimidoylglutamase  29.7 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3659  formimidoylglutamase  29.7 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3682  formimidoylglutamase  29.7 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  29.7 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3402  formimidoylglutamase  29.37 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.786826  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3757  formimidoylglutamase  29.7 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1559  formimidoylglutamase  29.37 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459006  normal  0.0875298 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3336  formimidoylglutamase  29.04 
 
 		 323 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.301376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2309  formimidoylglutamase  27.15 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3735  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.8 
 
 		 316 aa  105  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498261  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1481  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.04 
 
 		 267 aa  92.4  9e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.354652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4832  agmatinase  29.69 
 
 		 378 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  28.27 
 
 		 345 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  28.27 
 
 		 345 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  28.27 
 
 		 345 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  30.7 
 
 		 369 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0848  agmatinase  30.26 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.47 
 
 		 316 aa  86.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0232  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.82 
 
 		 328 aa  85.9  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  29.39 
 
 		 340 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  26.39 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3835  formiminoglutamase  28.72 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3224  agmatinase  29.57 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.583379  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0094  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3024  putative agmatinase  27.82 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197883  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  31.17 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  28.38 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  24.57 
 
 		 396 aa  79.3  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  28.38 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  28.38 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3869  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.15 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0814  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.67 
 
 		 385 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.237989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  30.64 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  31.3 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4042  formiminoglutamase  29.92 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.954236  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  28.75 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4572  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.14 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.708265  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3883  putative agmatinase  28.63 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5245  Agmatinase  23.89 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  29.18 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  26.34 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1823  putative agmatinase  30.42 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.397511  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0745  agmatinase  30.42 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00217133  hitchhiker  0.00435081 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  30.77 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  26.94 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2118  agmatinase  30.47 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  26.04 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  23.51 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.9 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  23.51 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1743  agmatinase  29.52 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  24.66 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  24.66 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  24.66 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0509  putative agmatinase  29.15 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1431  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.79 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  24.66 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  30.21 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>