282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0973 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0973  ApbE family lipoprotein  100 
 
 
313 aa  640    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  29.51 
 
 
342 aa  126  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  29.84 
 
 
336 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  32.06 
 
 
345 aa  122  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  27.83 
 
 
360 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  29.71 
 
 
417 aa  115  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  28.2 
 
 
366 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  29 
 
 
353 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  26.64 
 
 
381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  28.35 
 
 
348 aa  109  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  28.46 
 
 
339 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.59 
 
 
363 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  33.47 
 
 
349 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  27.51 
 
 
300 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  25.82 
 
 
317 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  28.86 
 
 
338 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  23.62 
 
 
320 aa  103  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  32.64 
 
 
349 aa  102  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  26.07 
 
 
386 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  26.97 
 
 
355 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  29.54 
 
 
389 aa  99.8  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  26.52 
 
 
350 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  27.82 
 
 
353 aa  98.6  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  28.62 
 
 
350 aa  98.2  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  25.09 
 
 
326 aa  98.6  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  28.48 
 
 
338 aa  98.2  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  26.27 
 
 
380 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  26.52 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  27.59 
 
 
335 aa  97.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  26.61 
 
 
302 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  27.92 
 
 
343 aa  95.9  7e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  26.61 
 
 
301 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.18 
 
 
336 aa  95.9  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  25.76 
 
 
300 aa  95.9  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  26.28 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  25.55 
 
 
275 aa  95.5  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  26.33 
 
 
361 aa  95.5  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  26.21 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  26.79 
 
 
346 aa  95.5  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  27.54 
 
 
348 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1898  ApbE family lipoprotein  26.78 
 
 
330 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0683316 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  28.42 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  25.81 
 
 
337 aa  93.6  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  27.52 
 
 
343 aa  93.2  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  28.17 
 
 
343 aa  92.8  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  22.95 
 
 
349 aa  92.8  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  25.81 
 
 
301 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  25.82 
 
 
344 aa  92.8  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  26.7 
 
 
310 aa  92.8  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  24.64 
 
 
339 aa  92.4  9e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2084  ApbE family lipoprotein  25.73 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.71 
 
 
347 aa  90.9  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  27.14 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  26.5 
 
 
350 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  27.05 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  25.76 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  29.24 
 
 
371 aa  90.9  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  24.9 
 
 
345 aa  89.7  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  26.42 
 
 
328 aa  89.7  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  23.96 
 
 
335 aa  89.4  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.26 
 
 
350 aa  89.4  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.7 
 
 
341 aa  89  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  25.62 
 
 
336 aa  89  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 
344 aa  88.6  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  26.43 
 
 
345 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  24.27 
 
 
352 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  24.27 
 
 
352 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.37 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  25.91 
 
 
339 aa  87.8  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  26.43 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  24.9 
 
 
306 aa  87.4  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  25.09 
 
 
370 aa  88.2  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  24.75 
 
 
348 aa  87.8  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.43 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  24.27 
 
 
370 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  25.86 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  22.96 
 
 
331 aa  87  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  27.27 
 
 
338 aa  87.4  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  24.5 
 
 
344 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  25.85 
 
 
379 aa  87  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.92 
 
 
349 aa  86.7  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  23.63 
 
 
349 aa  86.3  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  23.47 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  24.24 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0009  ApbE-like lipoprotein  20.75 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109653  normal  0.0510654 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  24.92 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  24.62 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  28.79 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  27.96 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  27.96 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  24.62 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3962  ApbE family lipoprotein  26.05 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.376919  normal  0.0354055 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  27.82 
 
 
348 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.68 
 
 
361 aa  84  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  27.54 
 
 
345 aa  84  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  23.68 
 
 
313 aa  84  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  27.82 
 
 
348 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  27.82 
 
 
348 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.49 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  27.82 
 
 
348 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>