293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4453 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4453  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 266 aa  555  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3770  Sel1 domain-containing protein  61.94 
 
 		 268 aa  342  4e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.476398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0976  Sel1 domain-containing protein  43.84 
 
 		 269 aa  226  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.135872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0528  Sel1 domain-containing protein  39.93 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4035  Sel1 domain-containing protein  39.41 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.163286 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0527  Sel1 domain-containing protein  38.49 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3249  Sel1 domain-containing protein  35.23 
 
 		 289 aa  175  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0529  Sel1 domain-containing protein  36.1 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  34.06 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1747  hypothetical protein  36.54 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  33.74 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  32.8 
 
 		 961 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  38.21 
 
 		 490 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  38.21 
 
 		 490 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  31.11 
 
 		 831 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  30.94 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  33.87 
 
 		 684 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  33.56 
 
 		 1402 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  29.41 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  31.36 
 
 		 489 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  35.09 
 
 		 536 aa  69.7  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.28 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  34.62 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.87 
 
 		 2413 aa  68.6  0.00000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  33.07 
 
 		 789 aa  68.6  0.00000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  34.92 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  31.11 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  34.33 
 
 		 1037 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 		 448 aa  67  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  23.74 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  32.26 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  32.26 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  32.26 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  32.26 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  30.53 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  37.4 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  37.1 
 
 		 1141 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  37.4 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  31.82 
 
 		 1044 aa  64.7  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2979  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.45 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.07 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  30.77 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  34.17 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  32.56 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  36.07 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  25.32 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.08 
 
 		 890 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  33.94 
 
 		 680 aa  63.5  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  29.3 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  32.82 
 
 		 1493 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  32.06 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 976 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  31.06 
 
 		 1078 aa  61.6  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.65 
 
 		 1012 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0371  hypothetical protein  35.59 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140367  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.08 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  26.43 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.85 
 
 		 382 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1877 aa  62  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  31.62 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  31.11 
 
 		 838 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2868  Sel1 domain-containing protein  26.62 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215406  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  31.58 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.77 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 1032 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  28.83 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  30.94 
 
 		 557 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  36 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  32.11 
 
 		 679 aa  60.1  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  32.79 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  25.67 
 
 		 817 aa  59.7  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  30.7 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0788  Sel1 domain-containing protein  30.51 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191842 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  36.79 
 
 		 523 aa  58.9  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1359  hypothetical protein  33.9 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129573  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  28.79 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3203  hypothetical protein  33.9 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0234  hypothetical protein  33.9 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4319  Sel1  32.8 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0068  hypothetical protein  33.9 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  24.38 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0610  hypothetical protein  33.9 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  37 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.21 
 
 		 1261 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.4 
 
 		 528 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0429  hypothetical protein  34.91 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417467  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  29.71 
 
 		 731 aa  57  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2732  Sel1  29.63 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000135758  unclonable  0.000000152447 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0448  hypothetical protein  33.9 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.325854  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  29.13 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2739  Sel1 repeat-containing protein  30.47 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0269187  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0657  Sel1 domain-containing protein  27.86 
 
 		 439 aa  56.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3066  Sel1 repeat-containing protein  23.91 
 
 		 432 aa  56.2  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.22 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  32.74 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.23 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  31.36 
 
 		 482 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  26.57 
 
 		 425 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  29.6 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>