More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1797 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1797  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 530 aa  1068    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2798  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.36 
 
 		 536 aa  623  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.8 
 
 		 544 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1755  histidine kinase  51.69 
 
 		 577 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210115  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1365  ATP-binding region, ATPase-like protein  41.92 
 
 		 567 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1548  ATP-binding region, ATPase-like protein  46.12 
 
 		 509 aa  350  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.269339  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0373  sensor histidine kinase  24.43 
 
 		 500 aa  118  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 581 aa  114  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  28.15 
 
 		 517 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4191  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 476 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000558631  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4418  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 611 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 655 aa  104  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 689 aa  102  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2997  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 490 aa  101  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  25.87 
 
 		 674 aa  100  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 655 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 656 aa  99.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  27.05 
 
 		 499 aa  98.6  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  26.18 
 
 		 468 aa  99  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 		 473 aa  98.2  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  25.74 
 
 		 656 aa  98.2  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 594 aa  97.8  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 510 aa  97.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.42 
 
 		 480 aa  97.8  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  28.09 
 
 		 506 aa  97.4  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3157  histidine kinase  27.21 
 
 		 484 aa  96.7  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  25.83 
 
 		 661 aa  96.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2355  sensor histidine kinase  24.69 
 
 		 482 aa  96.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 661 aa  95.9  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 		 662 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  25.72 
 
 		 484 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  26.15 
 
 		 419 aa  95.1  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  32.31 
 
 		 830 aa  95.1  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 540 aa  94.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2085  ATP-binding region ATPase domain protein  23.4 
 
 		 510 aa  95.1  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.158999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.21 
 
 		 671 aa  94  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 469 aa  94  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 492 aa  94  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 		 672 aa  94  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3652  sporulation kinase A  29.2 
 
 		 510 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 630 aa  93.6  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 471 aa  93.6  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3432  sporulation kinase A  29.2 
 
 		 510 aa  93.6  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0123298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3702  sporulation kinase A  29.2 
 
 		 510 aa  93.6  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4402  histidine kinase  26.23 
 
 		 471 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3601  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 399 aa  92.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  25.35 
 
 		 672 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 489 aa  92.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705046 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 		 498 aa  92  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  23 
 
 		 581 aa  92  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3749  sporulation kinase A  28.8 
 
 		 510 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  28.03 
 
 		 608 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.03 
 
 		 608 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  28.03 
 
 		 608 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  28.03 
 
 		 608 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  28.03 
 
 		 608 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1567  sporulation kinase A  28.8 
 
 		 510 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.800828 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3393  sporulation kinase A  28.8 
 
 		 510 aa  90.9  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.785669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3344  sporulation kinase A  28.8 
 
 		 510 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  28.03 
 
 		 608 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0916  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.74 
 
 		 599 aa  90.5  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000947728  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 483 aa  90.1  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 680 aa  90.1  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 475 aa  90.1  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0283  sensor histidine kinase  30.3 
 
 		 600 aa  89.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  26.42 
 
 		 573 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  25.36 
 
 		 487 aa  89.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0790  histidine kinase  29.57 
 
 		 522 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3818  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 468 aa  89.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.634058  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4055  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 		 586 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.174789 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  24.85 
 
 		 516 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2201  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 480 aa  89  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1846  histidine kinase  26.15 
 
 		 501 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.390703 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3670  sporulation kinase A  29.29 
 
 		 510 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.825905  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1793  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 591 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.456575  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 498 aa  88.2  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.08 
 
 		 457 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3674  sporulation kinase A  29.29 
 
 		 510 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.123371  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 929 aa  87.8  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 		 490 aa  87.8  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0625173  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 449 aa  87  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.749105  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 		 699 aa  86.7  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 		 396 aa  86.7  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  24.84 
 
 		 655 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000439067  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 768 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.35 
 
 		 378 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3327  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 510 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.26559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  28.39 
 
 		 617 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.62 
 
 		 656 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  26.71 
 
 		 502 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0437  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 412 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.148474  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 543 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.58 
 
 		 365 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 502 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 		 654 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0446  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 1527 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>