More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5511 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
322 aa  631  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.432995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.77 
 
 
325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44 
 
 
336 aa  250  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1851  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  45.69 
 
 
331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.737422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1822  oligopeptide transport integral membrane protein  41.23 
 
 
341 aa  237  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.661927  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3511  oligopeptide ABC transporter (permease)  43.63 
 
 
317 aa  235  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5914  ABC transporter, permease protein  43.45 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  0.0354831 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.05 
 
 
341 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.969826  hitchhiker  0.0068543 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24260  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  39.94 
 
 
313 aa  230  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 
344 aa  229  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000360148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1288  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.38 
 
 
336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 
349 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45 
 
 
321 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.01 
 
 
320 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.8 
 
 
308 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12460  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.54 
 
 
359 aa  189  8e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0599991  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0436  putative oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  37.1 
 
 
309 aa  186  6e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000260197 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
280 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.46 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
293 aa  173  5e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
280 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.37 
 
 
278 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00710  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.67 
 
 
328 aa  170  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.33 
 
 
284 aa  169  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
307 aa  168  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.81 
 
 
302 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  36.33 
 
 
293 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
341 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.671843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.95 
 
 
367 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 
304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
343 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.519425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
344 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
280 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  36.03 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000439393  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.78 
 
 
321 aa  163  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4431  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
299 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0488  putative oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  35 
 
 
330 aa  162  6e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.359431 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
285 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
325 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00471699  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
310 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
299 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  35.88 
 
 
288 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0256  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  34.11 
 
 
303 aa  160  4e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0738977  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002961  oligopeptide transport system permease protein OppC  33.87 
 
 
300 aa  159  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
295 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0250  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.99 
 
 
307 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
305 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238767  normal  0.85069 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  32.8 
 
 
302 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
270 aa  157  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0220  oligopeptide ABC transporter permease  33.99 
 
 
307 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0233  oligopeptide ABC transporter permease protein  33.99 
 
 
307 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0243  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.31 
 
 
307 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.7 
 
 
296 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0211  oligopeptide ABC transporter, permease  34.31 
 
 
307 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  33.88 
 
 
304 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  33.88 
 
 
304 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
310 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 
347 aa  156  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.435279  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
310 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
359 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1225  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
332 aa  156  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5078  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 
306 aa  155  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.5 
 
 
495 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99676  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3309  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.52 
 
 
314 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
347 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000434539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0247  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 
306 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0546254  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.62 
 
 
303 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
342 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.41 
 
 
303 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 
496 aa  154  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.41 
 
 
303 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 
319 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0184678  normal  0.258493 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
303 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.41 
 
 
303 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.08 
 
 
303 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
303 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
497 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.826633 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  34.08 
 
 
303 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  31.43 
 
 
300 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.7223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0370  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  34.68 
 
 
284 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.41 
 
 
303 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
307 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
308 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717145 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0268  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.31 
 
 
307 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6953  oligopeptide ABC transporter (permease protein)  38.16 
 
 
310 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.58 
 
 
299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
323 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.478272  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 
304 aa  152  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477815  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.09 
 
 
318 aa  152  8e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.643704  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 
307 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
287 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
342 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0349  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  34.65 
 
 
283 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
303 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>