More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2587 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
341 aa  667    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.969826  hitchhiker  0.0068543 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1822  oligopeptide transport integral membrane protein  78.01 
 
 
341 aa  543  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.661927  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.35 
 
 
349 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5914  ABC transporter, permease protein  66.47 
 
 
331 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  0.0354831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1851  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  63.37 
 
 
331 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.737422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.59 
 
 
344 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000360148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1288  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.14 
 
 
336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3511  oligopeptide ABC transporter (permease)  52.24 
 
 
317 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.29 
 
 
278 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24260  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  51.11 
 
 
313 aa  294  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.69 
 
 
308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.77 
 
 
336 aa  247  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.89 
 
 
321 aa  246  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.09 
 
 
325 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.2 
 
 
318 aa  235  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.07 
 
 
320 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  39.62 
 
 
299 aa  229  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  39.62 
 
 
299 aa  228  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  39.62 
 
 
299 aa  228  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  39.62 
 
 
299 aa  228  8e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  39.62 
 
 
299 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.56 
 
 
303 aa  222  9e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.12 
 
 
299 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.92 
 
 
301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1382  transmembrane ABC transporter protein  41.25 
 
 
299 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131281  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.58 
 
 
301 aa  218  7.999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.57 
 
 
303 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  42.57 
 
 
303 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  42.57 
 
 
303 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  42.57 
 
 
303 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 
299 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  42.57 
 
 
303 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  42.24 
 
 
303 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.24 
 
 
303 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  42.24 
 
 
303 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 
367 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0436  putative oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  40.97 
 
 
309 aa  216  4e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000260197 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 
296 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
301 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265268  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1924  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.25 
 
 
303 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  42.24 
 
 
303 aa  215  8e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
301 aa  215  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
299 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.51 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0322  putative ABC transport system permease protein  41.25 
 
 
302 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1850  ABC transporter permease  41.25 
 
 
302 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1765  putative glutathione ABC transporter, permease protein  41.25 
 
 
302 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0977  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  41.25 
 
 
302 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699856  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0399  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  41.25 
 
 
302 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19947  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0241  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  41.25 
 
 
302 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1356  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  41.25 
 
 
302 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.222916  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
299 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.23 
 
 
284 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.59 
 
 
325 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
300 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.0461956 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.73 
 
 
307 aa  209  5e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0838  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  39.51 
 
 
301 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00766751  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 
276 aa  209  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.03 
 
 
293 aa  208  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
294 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1115  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  41.91 
 
 
300 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  42.57 
 
 
317 aa  206  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.56 
 
 
280 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
308 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.05 
 
 
304 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.05 
 
 
322 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.432995 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
287 aa  203  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
274 aa  203  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
313 aa  203  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0919  glutathione transport system permease protein GsiD  41.75 
 
 
303 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.285756  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0981  glutathione transport system permease GsiD  41.75 
 
 
303 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 
300 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0952  glutathione transport system permease GsiD  41.75 
 
 
303 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1002  glutathione transport system permease GsiD  41.75 
 
 
303 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0892  glutathione transport system permease protein GsiD  41.75 
 
 
303 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
297 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110641  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
297 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774005  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
297 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
306 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.56 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172272  normal  0.144154 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  41.56 
 
 
282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  37.07 
 
 
293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1865  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  39.93 
 
 
297 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 
312 aa  200  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
344 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.56 
 
 
280 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.54 
 
 
343 aa  199  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.519425 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.94 
 
 
285 aa  199  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
309 aa  199  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 
318 aa  199  6e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.643704  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0003  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.05 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.158402  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.53 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003659  oligopeptide transport system permease protein OppC  38.59 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.03 
 
 
280 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.69 
 
 
313 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0216916  hitchhiker  0.00872775 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  37.46 
 
 
304 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  37.46 
 
 
304 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>