More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00710 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_00710  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  100 
 
 
328 aa  636    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24260  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  53.92 
 
 
313 aa  309  5e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.73 
 
 
308 aa  294  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0436  putative oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  51.88 
 
 
309 aa  282  5.000000000000001e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000260197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3511  oligopeptide ABC transporter (permease)  43 
 
 
317 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1822  oligopeptide transport integral membrane protein  38.12 
 
 
341 aa  223  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.661927  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5914  ABC transporter, permease protein  40.33 
 
 
331 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  0.0354831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 
344 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000360148  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 
341 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.969826  hitchhiker  0.0068543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.54 
 
 
318 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.27 
 
 
349 aa  211  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.1 
 
 
320 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1288  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 
336 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1851  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  39.66 
 
 
331 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.737422 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
336 aa  203  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.48 
 
 
278 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 
325 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
322 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.432995 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
299 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  33.55 
 
 
293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  40.07 
 
 
288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
306 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1382  transmembrane ABC transporter protein  35.07 
 
 
299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131281  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
303 aa  166  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  40.27 
 
 
282 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.32 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 
299 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  33.33 
 
 
303 aa  162  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
303 aa  162  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  33.68 
 
 
303 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
303 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.86 
 
 
284 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  33.68 
 
 
303 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  33.33 
 
 
303 aa  162  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  33.33 
 
 
303 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  33.33 
 
 
303 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  33.33 
 
 
303 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.6 
 
 
309 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.505775  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.3 
 
 
285 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0892  glutathione transport system permease protein GsiD  34.41 
 
 
303 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0981  glutathione transport system permease GsiD  34.41 
 
 
303 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1002  glutathione transport system permease GsiD  34.41 
 
 
303 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0919  glutathione transport system permease protein GsiD  34.41 
 
 
303 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.285756  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
301 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0952  glutathione transport system permease GsiD  34.41 
 
 
303 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
307 aa  159  5e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
294 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7325  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  33.86 
 
 
300 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
280 aa  159  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003659  oligopeptide transport system permease protein OppC  34.43 
 
 
310 aa  159  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
299 aa  159  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.7 
 
 
301 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265268  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
299 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1115  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  34.74 
 
 
300 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172272  normal  0.144154 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.64 
 
 
302 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0838  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  32.7 
 
 
301 aa  156  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00766751  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.23 
 
 
300 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.0461956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
285 aa  156  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
297 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1924  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.99 
 
 
303 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
280 aa  155  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
301 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
301 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
297 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774005  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
297 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723958 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
294 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 
300 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
318 aa  154  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.643704  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.671843  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3119  IM pore protein  41.47 
 
 
312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.141306  normal  0.0623657 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  33.95 
 
 
299 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  33.95 
 
 
299 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  33.95 
 
 
299 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
297 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  33.95 
 
 
299 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  33.95 
 
 
299 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
297 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110641  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0977  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 
302 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699856  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0399  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 
302 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19947  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0241  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 
302 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1356  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 
302 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.222916  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26150  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.98 
 
 
331 aa  152  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.286946  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0322  putative ABC transport system permease protein  34.04 
 
 
302 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.66 
 
 
287 aa  152  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5301  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  33.66 
 
 
296 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.527833  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1850  ABC transporter permease  34.04 
 
 
302 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1765  putative glutathione ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 
302 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
284 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.5 
 
 
291 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
306 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
310 aa  151  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1865  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  33.22 
 
 
297 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
273 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.609485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  35.6 
 
 
867 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.81 
 
 
277 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.486684  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
311 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
309 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>