More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0954 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
341 aa  679    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.671843  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.46 
 
 
316 aa  374  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.48 
 
 
314 aa  289  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000570196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.93 
 
 
330 aa  286  5e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.403444  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26150  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  49.83 
 
 
331 aa  285  5.999999999999999e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.286946  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8932  dipeptide ABC transporter (permease)  52.03 
 
 
308 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3152  oligopeptide ABC transporter (permease)  47.74 
 
 
296 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279701  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
322 aa  277  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848155  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.68 
 
 
307 aa  276  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0256  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  47.55 
 
 
303 aa  276  3e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0738977  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0488  putative oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  42.95 
 
 
330 aa  275  7e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.359431 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3309  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  47.78 
 
 
314 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.37 
 
 
312 aa  265  7e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736196  hitchhiker  0.00675709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3798  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.33 
 
 
322 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11070  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  43.71 
 
 
318 aa  263  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.682818  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3821  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.02 
 
 
313 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0857155  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.15 
 
 
309 aa  256  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.505775  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3913  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.71 
 
 
316 aa  255  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12590  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  41.62 
 
 
347 aa  253  3e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.219021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.97 
 
 
309 aa  249  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.91 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13694  dipeptide-transport integral membrane protein ABC transporter dppC  48.43 
 
 
266 aa  242  5e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0652275 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.88 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
310 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0465132  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.63 
 
 
302 aa  212  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  42.59 
 
 
288 aa  206  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.47 
 
 
284 aa  206  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 
311 aa  206  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.910518  normal  0.0436133 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  42.75 
 
 
282 aa  206  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.22 
 
 
280 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0643  oligopeptide ABC transporter, permease protein  40.29 
 
 
292 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
310 aa  204  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
301 aa  204  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.59 
 
 
287 aa  203  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  36.08 
 
 
299 aa  202  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  36.08 
 
 
299 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  36.08 
 
 
299 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  36.08 
 
 
299 aa  202  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  36.08 
 
 
299 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
303 aa  200  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.44 
 
 
343 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.519425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
299 aa  199  7e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499686  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  38.01 
 
 
303 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
303 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
299 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  38.01 
 
 
303 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  37.67 
 
 
303 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  37.67 
 
 
303 aa  196  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  37.67 
 
 
303 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 
287 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.144364 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  37.67 
 
 
303 aa  195  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  36.46 
 
 
293 aa  195  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_930  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.62 
 
 
301 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.438382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
293 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 
280 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  37.33 
 
 
303 aa  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0322  putative ABC transport system permease protein  39.45 
 
 
302 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1850  ABC transporter permease  39.45 
 
 
302 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1765  putative glutathione ABC transporter, permease protein  39.45 
 
 
302 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1382  transmembrane ABC transporter protein  37.72 
 
 
299 aa  192  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131281  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0977  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  39.45 
 
 
302 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699856  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0399  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  39.45 
 
 
302 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19947  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0241  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  39.45 
 
 
302 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1356  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  39.45 
 
 
302 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.222916  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
299 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
301 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265268  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
341 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.969826  hitchhiker  0.0068543 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0638  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  33.45 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
301 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
342 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1115  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  39.79 
 
 
300 aa  190  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
299 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 
344 aa  189  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000360148  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
318 aa  189  5e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.643704  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0838  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  38.75 
 
 
301 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00766751  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.62 
 
 
301 aa  189  8e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1822  oligopeptide transport integral membrane protein  37.18 
 
 
341 aa  189  9e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.661927  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
309 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
285 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
310 aa  188  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1282  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.45 
 
 
300 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284613  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1865  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  38.06 
 
 
297 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
304 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
297 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774005  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
297 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723958 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
285 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
297 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
297 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110641  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 
303 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1924  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.02 
 
 
303 aa  186  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1851  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.12 
 
 
331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.737422 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172272  normal  0.144154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>