More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3821 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3821  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
313 aa  631  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0857155  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  89.78 
 
 
312 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736196  hitchhiker  0.00675709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.33 
 
 
309 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.84 
 
 
330 aa  271  8.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.403444  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.56 
 
 
322 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848155  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.82 
 
 
314 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000570196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.71 
 
 
307 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0256  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  46.95 
 
 
303 aa  263  2e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0738977  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26150  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  50 
 
 
331 aa  263  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.286946  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8932  dipeptide ABC transporter (permease)  48.18 
 
 
308 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.02 
 
 
341 aa  261  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.671843  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3152  oligopeptide ABC transporter (permease)  45.42 
 
 
296 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279701  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0488  putative oligopeptide ABC transporter, permease protein OppC  43.24 
 
 
330 aa  257  2e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.359431 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11070  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  46.76 
 
 
318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.682818  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.03 
 
 
316 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3798  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.56 
 
 
322 aa  247  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.79 
 
 
326 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3309  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  44.83 
 
 
314 aa  246  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12590  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  41.18 
 
 
347 aa  242  6e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.219021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.41 
 
 
309 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.505775  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3913  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13694  dipeptide-transport integral membrane protein ABC transporter dppC  44.53 
 
 
266 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0652275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.34 
 
 
311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.910518  normal  0.0436133 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1822  oligopeptide transport integral membrane protein  37.05 
 
 
341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.661927  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
299 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5914  ABC transporter, permease protein  37.12 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  0.0354831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
299 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.77 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.49 
 
 
293 aa  189  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.06 
 
 
349 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1851  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.63 
 
 
331 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.737422 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
307 aa  188  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 
318 aa  187  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.643704  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  37.41 
 
 
279 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  39.23 
 
 
288 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
311 aa  186  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
299 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  37.04 
 
 
301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
296 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
310 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5359  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  39.5 
 
 
289 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.632265  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24260  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37 
 
 
313 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  39.37 
 
 
282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.29 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
341 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.969826  hitchhiker  0.0068543 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0718  hypothetical protein  38.31 
 
 
282 aa  180  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.661918 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1412  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 
342 aa  179  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
301 aa  179  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
303 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.16 
 
 
285 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3511  oligopeptide ABC transporter (permease)  37.85 
 
 
317 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.29 
 
 
309 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
344 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000360148  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.83 
 
 
270 aa  176  4e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
291 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 
343 aa  175  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.519425 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.68 
 
 
284 aa  175  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.42 
 
 
313 aa  175  9e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
344 aa  175  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 
344 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.85 
 
 
469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15550  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  34.47 
 
 
396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.409579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.59 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  38.79 
 
 
300 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
303 aa  172  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.79 
 
 
300 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
279 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
295 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
307 aa  172  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
307 aa  172  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.385135  normal  0.0216142 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
300 aa  172  7.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  35.25 
 
 
303 aa  172  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
359 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
312 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
282 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.980051  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
310 aa  171  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
304 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  32.86 
 
 
293 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  37.82 
 
 
288 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 
310 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
303 aa  170  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  35.25 
 
 
303 aa  170  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  35.25 
 
 
303 aa  170  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  39.75 
 
 
304 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2256  oligopeptide ABC transporter, permease component  39.75 
 
 
304 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
324 aa  170  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.588573  decreased coverage  0.00594817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1225  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
332 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  35.25 
 
 
303 aa  170  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
303 aa  169  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  35.25 
 
 
303 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  35.25 
 
 
303 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
300 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
308 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4965  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
309 aa  170  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.031791  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>