More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0835 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0835  ATP-cone domain protein  100 
 
 		 154 aa  306  5e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1574  ATP-cone domain protein  54.42 
 
 		 154 aa  160  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  46 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 158 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 153 aa  143  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  47.86 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  44.37 
 
 		 163 aa  141  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  41.18 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  40.91 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1330  transcriptional regulator NrdR  45.7 
 
 		 151 aa  140  8e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  41.18 
 
 		 153 aa  140  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  41.89 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  41.1 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  41.72 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  41.72 
 
 		 158 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1623  transcriptional regulator NrdR  40.91 
 
 		 159 aa  135  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00056172  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  43.45 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  40.14 
 
 		 154 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  41.22 
 
 		 153 aa  133  8e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  42.86 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  45.89 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  43.54 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  39.61 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  38.56 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  38.56 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  38.56 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  38.56 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  38.56 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  38.56 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  38.56 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  38.56 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  38.56 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  38.1 
 
 		 157 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  38 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  38 
 
 		 156 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  38 
 
 		 155 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  41.89 
 
 		 184 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  40 
 
 		 150 aa  130  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  38.56 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  37.09 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  38.56 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  40 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  40.82 
 
 		 163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  40.82 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2928  transcriptional regulator NrdR  39.46 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3071  transcriptional regulator NrdR  39.6 
 
 		 179 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3049  transcriptional regulator NrdR  39.6 
 
 		 179 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000710191  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0352  transcriptional regulator NrdR  45.83 
 
 		 149 aa  126  9.000000000000001e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  38.67 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0319  transcriptional regulator NrdR  40.54 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  35.37 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  38.67 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  39.6 
 
 		 180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1916  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  39.46 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  39.46 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  34.21 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4664  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  41.72 
 
 		 175 aa  124  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  39.74 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  38.41 
 
 		 151 aa  124  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1659  transcriptional regulator NrdR  39.31 
 
 		 165 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242165  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  37.58 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03381  transcriptional regulator NrdR  39.19 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.36226  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2150  transcriptional regulator NrdR  37.75 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0932637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  37.91 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13480  transcriptional regulator, NrdR family  37.16 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  35.71 
 
 		 174 aa  122  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  37.91 
 
 		 175 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  38.16 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  37.91 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  39.33 
 
 		 172 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0701  transcriptional regulator NrdR  41.33 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2242  transcriptional regulator NrdR  38.67 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.279557  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2224  ATP-cone domain protein  38 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1584  transcriptional regulator NrdR  37.5 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2580  transcriptional regulator NrdR  41.33 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0684  transcriptional regulator NrdR  41.33 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.701389  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1810  ATP-cone domain protein  36.67 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.281201  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0776  transcriptional regulator NrdR  41.33 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.327359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1143  transcriptional regulator NrdR  36.91 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.086063  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22151  transcriptional regulator NrdR  34.64 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0472  transcriptional regulator NrdR  41.33 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.687081  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0807  transcriptional regulator NrdR  41.33 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0296  transcriptional regulator NrdR  41.33 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  37.33 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03461  transcriptional regulator NrdR  39.19 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2875  transcriptional regulator NrdR  38.89 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.362854  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  37.33 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03371  transcriptional regulator NrdR  39.19 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  37.41 
 
 		 156 aa  120  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  35.57 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0604  transcriptional regulator NrdR  40 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0843  transcriptional regulator NrdR  40.94 
 
 		 155 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.918743 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2047  transcriptional regulator NrdR  40.94 
 
 		 155 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.798764  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>