164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2973 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2973  FHA domain containing protein  100 
 
 
264 aa  542  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.247002 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  35.88 
 
 
848 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2478  FHA domain containing protein  42.86 
 
 
142 aa  63.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1079  FHA domain containing protein  35.29 
 
 
317 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.153112 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2548  FHA-domain containing protein  46.27 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00800  FHA domain-containing protein  46.48 
 
 
186 aa  58.9  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.151264  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1823  FHA domain-containing protein  38.1 
 
 
863 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.997566  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2061  FHA domain-containing protein  37.33 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2321  FHA domain-containing protein  41.27 
 
 
97 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  38.89 
 
 
241 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  40.85 
 
 
851 aa  56.6  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1427  FHA domain containing protein  41.18 
 
 
245 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0921  FHA domain containing protein  43.08 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  37.5 
 
 
238 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2521  FHA domain-containing protein  40.74 
 
 
946 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.295094 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  41.03 
 
 
851 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5167  FHA domain containing protein  37.5 
 
 
320 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.445837  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2309  FHA domain-containing protein  38.81 
 
 
279 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0931454  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0951  FHA-domain containing protein  38.46 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.64 
 
 
606 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3464  FHA domain containing protein  32.69 
 
 
694 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0731719  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27030  FHA domain-containing protein  37.31 
 
 
474 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  40.85 
 
 
385 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0338  FHA domain-containing protein  41.79 
 
 
144 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0330  FHA domain-containing protein  40.3 
 
 
144 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  35.62 
 
 
861 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  35.62 
 
 
869 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0060  FHA domain-containing protein  40.28 
 
 
175 aa  52.8  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.399884  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1788  FHA domain containing protein  38.46 
 
 
153 aa  52.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  38.03 
 
 
388 aa  52  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  40 
 
 
849 aa  52  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.5 
 
 
933 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0057  FHA domain-containing protein  37.5 
 
 
150 aa  51.6  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00934225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.81 
 
 
838 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1069  FHA domain containing protein  32.58 
 
 
516 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.793595  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2377  adenylate/guanylate cyclase  38.57 
 
 
395 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.5 
 
 
856 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  40.62 
 
 
895 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
523 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1709  FHA domain-containing protein  39.73 
 
 
268 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0424  FHA domain-containing protein  26.11 
 
 
377 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4677  FHA domain-containing protein  35.29 
 
 
225 aa  49.3  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2611  FHA domain-containing protein  34.72 
 
 
632 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.638236  normal  0.0395029 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0638  FHA domain-containing protein  30 
 
 
1559 aa  49.3  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.449825  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03340  FHA domain-containing protein  35.82 
 
 
408 aa  48.9  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0411441  normal  0.659189 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4329  FHA domain-containing protein  34.38 
 
 
228 aa  48.9  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24475  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1780  FHA domain-containing protein  39.73 
 
 
154 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000257566  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3613  FHA domain containing protein  37.5 
 
 
157 aa  48.9  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140351  hitchhiker  0.00128978 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3061  FHA domain-containing protein  49.02 
 
 
159 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1103  FHA domain-containing protein  36.11 
 
 
152 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2426  FHA domain containing protein  27.13 
 
 
1346 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0389758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2060  FHA domain-containing protein  39.73 
 
 
154 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52887  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14970  FHA domain-containing protein  30.26 
 
 
152 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0364194  normal  0.592543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0865  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.646672 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21520  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  31.53 
 
 
1488 aa  48.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3611  FHA domain containing protein  31.58 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331547  hitchhiker  0.0013234 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4924  FHA domain-containing protein  37.88 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.219389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  35.82 
 
 
866 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5251  FHA domain containing protein  36.49 
 
 
168 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.462718 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  35.82 
 
 
866 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  35.82 
 
 
866 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0035  FHA domain protein  39.29 
 
 
178 aa  47.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  33.82 
 
 
546 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  35.82 
 
 
863 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  28.71 
 
 
518 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5712  diguanylate cyclase  34.78 
 
 
316 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.54195  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0116  FHA domain containing protein-like protein  45.76 
 
 
155 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0851255  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4978  FHA domain-containing protein  31.94 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.064902  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1378  hypothetical protein  41.07 
 
 
176 aa  47.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0050  FHA domain-containing protein  36.99 
 
 
156 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00259691  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0856  adenylate/guanylate cyclase  33.75 
 
 
350 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.238934  hitchhiker  0.00191471 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2063  FHA domain containing protein  42.62 
 
 
209 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3940  FHA domain-containing protein  32.35 
 
 
225 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1115  ATPase  39.68 
 
 
117 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474042  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3359  hypothetical protein  37.14 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.110922 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0621  serine/threonine kinase protein  36.25 
 
 
407 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109473  hitchhiker  0.00845056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3949  FHA domain-containing protein  35.29 
 
 
188 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0228001 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5407  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35.14 
 
 
463 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  29.36 
 
 
427 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0041  FHA domain containing protein  33.8 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  26.27 
 
 
518 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3359  forkhead-associated  35.29 
 
 
234 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  36.25 
 
 
533 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0026  FHA domain-containing protein  34.72 
 
 
149 aa  47  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26930  FHA domain-containing protein  34.26 
 
 
237 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.583878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  41.27 
 
 
910 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0908  FHA domain-containing protein  47.06 
 
 
162 aa  46.6  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000938723  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.46 
 
 
777 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4189  adenylate/guanylate cyclase  37.68 
 
 
336 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0924354 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0436  hypothetical protein  30.25 
 
 
230 aa  46.2  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0167824 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0026  FHA domain-containing protein  29.85 
 
 
280 aa  46.2  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5557  FHA domain containing protein  34.02 
 
 
298 aa  45.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3612  FHA domain containing protein  30.56 
 
 
514 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  hitchhiker  0.00187032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0139  FHA domain-containing protein  43.4 
 
 
179 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0141963  hitchhiker  0.00495704 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03330  FHA domain-containing protein  44.9 
 
 
138 aa  45.8  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0536542  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4431  FHA domain-containing protein  45.1 
 
 
165 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2955 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0159  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
172 aa  45.8  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1189  FHA domain-containing protein  37.93 
 
 
162 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.280321  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3741  FHA domain-containing protein  32.41 
 
 
245 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.142285  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 
515 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>