More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1115 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1115  ATPase  100 
 
 		 117 aa  247  4e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0494  FHA domain-containing protein  37.93 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0075919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.51 
 
 		 606 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3359  forkhead-associated  33.33 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  41.18 
 
 		 849 aa  62  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1054  FHA domain-containing protein  35.63 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000340466  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  40.54 
 
 		 890 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4329  FHA domain-containing protein  35.87 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24475  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.44 
 
 		 838 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  38.57 
 
 		 895 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1434  FHA domain-containing protein  38.36 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0740529  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0047  FHA domain-containing protein  39.76 
 
 		 253 aa  60.1  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.183651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  45.31 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0041  FHA domain containing protein  48.39 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.14 
 
 		 933 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0908  FHA domain-containing protein  44.74 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000938723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  37.8 
 
 		 851 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3849  FHA domain containing protein  35.8 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.149542  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0067  hypothetical protein  34.94 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0191  FHA domain-containing protein  32.95 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3491  FHA domain containing protein  39.47 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0042  FHA domain-containing protein  39.76 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2548  FHA-domain containing protein  40 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0921  FHA domain containing protein  34.69 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2321  FHA domain-containing protein  35.16 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  40.91 
 
 		 848 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6477  FHA domain-containing protein  41.27 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0374778 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  43.66 
 
 		 866 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00800  FHA domain-containing protein  38.55 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.151264  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  43.66 
 
 		 866 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  43.66 
 
 		 866 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0874  FHA domain containing protein  35 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2061  FHA domain-containing protein  43.08 
 
 		 242 aa  57  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0338  FHA domain-containing protein  36.49 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2521  FHA domain-containing protein  36.36 
 
 		 946 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.295094 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  45.31 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3940  FHA domain-containing protein  34.52 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03340  FHA domain-containing protein  40.58 
 
 		 408 aa  55.5  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0411441  normal  0.659189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0139  FHA domain-containing protein  42.25 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0141963  hitchhiker  0.00495704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  34.41 
 
 		 546 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.71 
 
 		 856 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4677  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13850  FHA domain-containing protein  42.11 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0330  FHA domain-containing protein  36.49 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.93 
 
 		 910 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2371  diguanylate cyclase  38.36 
 
 		 294 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.191081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0116  FHA domain containing protein-like protein  35.87 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0851255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1823  FHA domain-containing protein  32.97 
 
 		 863 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.997566  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4043  FHA domain-containing protein  31.18 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3388  FHA domain containing protein  31.18 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4979  FHA domain-containing protein  46.15 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232716  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1632  FHA domain containing protein  40.28 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14970  FHA domain-containing protein  40 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0364194  normal  0.592543 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0136  diguanylate cyclase  42.47 
 
 		 288 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.041844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0865  FHA domain-containing protein  36 
 
 		 237 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.68 
 
 		 777 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2211  Forkhead-associated protein  38.81 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0048  FHA domain-containing protein  41.46 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0878  Forkhead-associated protein  33.68 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  39.44 
 
 		 869 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1693  FHA domain-containing protein  37.5 
 
 		 167 aa  52.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514614  normal  0.923966 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3479  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.36 
 
 		 554 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2647  putative sigma54 specific transcriptional regulator  38.36 
 
 		 467 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2713  forkhead-associated protein  34.25 
 
 		 176 aa  52.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0068  FHA domain containing protein  39.47 
 
 		 166 aa  52.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4680  FHA domain-containing protein  34.41 
 
 		 219 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3949  FHA domain-containing protein  32.39 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0228001 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3611  FHA domain containing protein  33.77 
 
 		 279 aa  52.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331547  hitchhiker  0.0013234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0043  FHA domain-containing protein  41.46 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  42.65 
 
 		 851 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0077  FHA domain containing protein  37.66 
 
 		 234 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.43292  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3039  FHA domain containing protein  38.46 
 
 		 414 aa  53.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0092  FHA domain containing protein  42.86 
 
 		 219 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3334  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.81 
 
 		 554 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448587  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4431  FHA domain-containing protein  42.65 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2955 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1117  FHA domain-containing protein  28.45 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0556817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4227  FHA domain containing protein  35.21 
 
 		 308 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  37.18 
 
 		 1011 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0027  forkhead-associated protein  48.08 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.620379  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4978  FHA domain-containing protein  36.76 
 
 		 242 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.064902  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0219  diguanylate cyclase  37.84 
 
 		 303 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2339  FHA domain containing protein  40.28 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.53176  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1816  FHA domain-containing protein  37.97 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3956  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 		 455 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.382581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4365  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.24 
 
 		 444 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000961656  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3848  FHA domain containing protein  36.99 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105283  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0040  FHA domain containing protein  35.29 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.906333  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  30.77 
 
 		 513 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1581  FHA domain containing protein  32.95 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.10755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0103  FHA domain containing protein  38.03 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5407  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.94 
 
 		 463 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1378  hypothetical protein  34.12 
 
 		 176 aa  51.2  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  38.03 
 
 		 861 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0023  FHA domain containing protein  37.84 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2520  FHA domain-containing protein  39.71 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2382  forkhead-associated protein  39.71 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2992  diguanylate phosphodiesterase  31.4 
 
 		 387 aa  50.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1427  FHA domain containing protein  33.73 
 
 		 245 aa  50.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2726  FHA domain containing protein  39.71 
 
 		 170 aa  50.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800491  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  38.03 
 
 		 863 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>