More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0878 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0878  Forkhead-associated protein  100 
 
 
161 aa  327  6e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2211  Forkhead-associated protein  36.62 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2818  FHA domain-containing protein  44.74 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27030  FHA domain-containing protein  37.78 
 
 
474 aa  67.8  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2336  FHA domain containing protein  43.59 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00703004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3611  FHA domain containing protein  43.68 
 
 
279 aa  67  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331547  hitchhiker  0.0013234 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18260  FHA domain-containing protein  40.74 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4219  Forkhead-associated protein  42.53 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1735  Forkhead-associated protein  34.19 
 
 
269 aa  64.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.164124  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2478  FHA domain containing protein  36.36 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0907  FHA domain-containing protein  40.79 
 
 
252 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000610253  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03340  FHA domain-containing protein  42.31 
 
 
408 aa  62.8  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0411441  normal  0.659189 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0494  FHA domain-containing protein  41.03 
 
 
236 aa  62.4  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0075919  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  35.16 
 
 
238 aa  62.4  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3940  FHA domain-containing protein  33.06 
 
 
225 aa  61.6  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1434  FHA domain-containing protein  44.12 
 
 
152 aa  61.6  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0740529  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1709  FHA domain-containing protein  38.75 
 
 
268 aa  61.6  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6711  putative sigma54 specific transcriptional regulator  48.39 
 
 
448 aa  61.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3039  FHA domain containing protein  40.79 
 
 
414 aa  60.8  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0103  FHA domain containing protein  41.33 
 
 
189 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1775  hypothetical protein  35.79 
 
 
302 aa  59.7  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00409515  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0473  hypothetical protein  44.93 
 
 
147 aa  59.7  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.592992  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1341  FHA domain containing protein  46.15 
 
 
374 aa  59.3  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.74 
 
 
606 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0726  FHA domain containing protein  38.37 
 
 
198 aa  58.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.192616 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0951  FHA-domain containing protein  40 
 
 
269 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  41.77 
 
 
241 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2309  FHA domain-containing protein  42.42 
 
 
279 aa  58.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0931454  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2061  FHA domain-containing protein  41.89 
 
 
242 aa  58.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2992  diguanylate phosphodiesterase  42.47 
 
 
387 aa  58.2  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0012  FHA domain containing protein  45.9 
 
 
252 aa  57.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.421198  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1886  FHA domain containing protein  38.03 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0328071 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1738  FHA domain containing protein  38.75 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.148575  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3388  FHA domain containing protein  37.33 
 
 
211 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5712  diguanylate cyclase  39.08 
 
 
316 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.54195  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4043  FHA domain-containing protein  37.33 
 
 
211 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2456  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
201 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00798291  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1395  forkhead-associated  38.75 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2726  FHA domain containing protein  38.04 
 
 
170 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800491  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1302  FHA domain containing protein  36.25 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2647  putative sigma54 specific transcriptional regulator  35.56 
 
 
467 aa  55.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2319  FHA domain containing protein  27.47 
 
 
210 aa  55.1  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3849  FHA domain containing protein  37.5 
 
 
267 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.149542  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2044  FHA domain-containing protein  43.24 
 
 
405 aa  54.7  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130358  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3479  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.62 
 
 
554 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3491  FHA domain containing protein  37.18 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00720  FHA domain protein  38.64 
 
 
269 aa  54.3  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0489007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8053  FHA repeat-domain-containing protein-like protein  38.46 
 
 
181 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0730272  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2844  FHA domain-containing protein  35.87 
 
 
158 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2888  FHA domain-containing protein  35.87 
 
 
158 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2875  FHA domain-containing protein  35.87 
 
 
158 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  35.96 
 
 
630 aa  53.9  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2434  FHA domain containing protein  37.04 
 
 
178 aa  53.9  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00264365  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  38.89 
 
 
546 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0908  FHA domain-containing protein  35.87 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000938723  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1693  FHA domain-containing protein  40.79 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514614  normal  0.923966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5356  FHA domain containing protein  41.1 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1115  ATPase  33.68 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474042  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1226  FHA domain-containing protein  38.75 
 
 
177 aa  53.9  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22590  FHA domain-containing protein  41.67 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.781297  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3135  FHA domain-containing protein  38.75 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547801  normal  0.0667215 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4680  FHA domain-containing protein  38.67 
 
 
219 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5407  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.11 
 
 
463 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26940  FHA domain-containing protein  32.91 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.216801  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3402  FHA domain-containing protein  38.75 
 
 
183 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10779  normal  0.511824 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0798  FHA domain protein  41.43 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3399  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  33.33 
 
 
557 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0150052  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3334  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.62 
 
 
554 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448587  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0030  FHA domain containing protein  38.71 
 
 
169 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4677  FHA domain-containing protein  36.05 
 
 
225 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4783  FHA domain-containing protein  37.5 
 
 
236 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3045  FHA domain-containing protein  38.96 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000453276  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0219  diguanylate cyclase  31.07 
 
 
303 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13850  FHA domain-containing protein  40.58 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2102  FHA domain containing protein  38.24 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0175  FHA domain containing protein  45.28 
 
 
152 aa  52.4  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545255  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1125  FHA domain containing protein  35.71 
 
 
164 aa  52  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2520  FHA domain-containing protein  40.3 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4329  FHA domain-containing protein  32.47 
 
 
228 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24475  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2382  forkhead-associated protein  40.3 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2598  Forkhead-associated protein  38.16 
 
 
350 aa  52  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11857  hypothetical protein  37.5 
 
 
162 aa  52  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.751406 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0026  FHA domain-containing protein  42.19 
 
 
280 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0136  FHA domain containing protein  36.17 
 
 
177 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.240573 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  32.04 
 
 
1011 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2541  FHA domain containing protein  35.87 
 
 
268 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0291194  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3897  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.4 
 
 
477 aa  51.6  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  39.06 
 
 
910 aa  51.2  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3415  putative sigma54 specific transcriptional regulator  33.33 
 
 
554 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.417822  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1847  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  43.75 
 
 
675 aa  51.2  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1468  FHA domain-containing protein  40.51 
 
 
181 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2371  diguanylate cyclase  31.43 
 
 
294 aa  50.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.191081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1456  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.84 
 
 
623 aa  50.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.80149  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  34.67 
 
 
533 aa  50.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2158  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
306 aa  50.8  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2866  FHA domain containing protein  34.02 
 
 
208 aa  50.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.176528 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3096  FHA domain containing protein  38.2 
 
 
170 aa  50.8  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424895  normal  0.0108449 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0023  FHA domain containing protein  40.91 
 
 
170 aa  50.4  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  33.04 
 
 
1108 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3742  FHA domain-containing protein  38.89 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.160479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>