252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1117 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1117  FHA domain-containing protein  100 
 
 
116 aa  238  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0556817  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3949  FHA domain-containing protein  40.4 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0228001 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0338  FHA domain-containing protein  48.15 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0067  hypothetical protein  35.71 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0330  FHA domain-containing protein  46.91 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4677  FHA domain-containing protein  37.74 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0191  FHA domain-containing protein  38.1 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4680  FHA domain-containing protein  35.85 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0865  FHA domain-containing protein  36.84 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.646672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4783  FHA domain-containing protein  38.3 
 
 
236 aa  67  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3940  FHA domain-containing protein  34.74 
 
 
225 aa  67  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2735  FHA domain-containing protein  41.84 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.285351  normal  0.211409 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2063  FHA domain containing protein  42.31 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3614  Forkhead-associated protein  39.74 
 
 
835 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158405  hitchhiker  0.00251691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0921  FHA domain containing protein  35.11 
 
 
250 aa  63.5  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27030  FHA domain-containing protein  38.38 
 
 
474 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5188  FHA domain containing protein  35.48 
 
 
218 aa  62.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3388  FHA domain containing protein  34.91 
 
 
211 aa  62  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4043  FHA domain-containing protein  34.91 
 
 
211 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0219  diguanylate cyclase  37.78 
 
 
303 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0951  FHA-domain containing protein  34.65 
 
 
269 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3658  winged helix family two component response transcriptional regulator  35.79 
 
 
220 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3359  forkhead-associated  30.28 
 
 
234 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1788  FHA domain containing protein  36.71 
 
 
153 aa  57.4  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0030  FHA domain containing protein  39.24 
 
 
169 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  34.65 
 
 
1011 aa  57  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4978  FHA domain-containing protein  34.04 
 
 
242 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.064902  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1434  FHA domain-containing protein  37.65 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0740529  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0023  FHA domain containing protein  40.3 
 
 
170 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  35.23 
 
 
566 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  39.24 
 
 
379 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  34.78 
 
 
1065 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1480  winged helix family two component response transcriptional regulator  33.68 
 
 
221 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.723328 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0494  FHA domain-containing protein  30.43 
 
 
236 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0075919  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3135  FHA domain-containing protein  37.89 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547801  normal  0.0667215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  40.79 
 
 
1004 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  34 
 
 
630 aa  55.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3039  FHA domain containing protein  36.36 
 
 
414 aa  54.3  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4227  FHA domain containing protein  35.56 
 
 
308 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208424  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0013  FHA domain containing protein  39.24 
 
 
170 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.943282  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14970  FHA domain-containing protein  38.37 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0364194  normal  0.592543 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0091  FHA domain containing protein  35.44 
 
 
170 aa  53.9  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.16 
 
 
890 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0997  FHA domain-containing protein  39.29 
 
 
603 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03340  FHA domain-containing protein  30.93 
 
 
408 aa  53.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0411441  normal  0.659189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0026  FHA domain-containing protein  37.65 
 
 
280 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2371  diguanylate cyclase  34 
 
 
294 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.191081 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0116  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  40.74 
 
 
219 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11857  hypothetical protein  36.84 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.751406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2061  FHA domain-containing protein  34.09 
 
 
242 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1125  FHA domain containing protein  36.26 
 
 
164 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1115  ATPase  28.45 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474042  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2844  FHA domain-containing protein  37.5 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0025  FHA domain-containing protein  32.58 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1054  FHA domain-containing protein  34.57 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000340466  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2888  FHA domain-containing protein  37.5 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2875  FHA domain-containing protein  37.5 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3402  FHA domain-containing protein  35.11 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10779  normal  0.511824 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0049  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
245 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.0038838  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  32.98 
 
 
241 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3040  FHA domain containing protein  36 
 
 
137 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1490  FHA domain-containing protein  34.15 
 
 
218 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  37.84 
 
 
848 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2775  Forkhead-associated protein  38.27 
 
 
149 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105667  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4010  FHA domain containing protein  41.79 
 
 
156 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.196899  normal  0.106089 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3060  FHA domain-containing protein  37.93 
 
 
253 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00230  FHA domain-containing protein  36.71 
 
 
160 aa  51.2  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.853372  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0175  FHA domain containing protein  35.06 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545255  normal  0.675228 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4979  FHA domain-containing protein  39.51 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232716  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2339  FHA domain containing protein  35.96 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.53176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1079  FHA domain containing protein  32.22 
 
 
317 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.153112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0031  FHA domain containing protein  32.97 
 
 
161 aa  51.2  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.74184  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0908  FHA domain-containing protein  37.97 
 
 
162 aa  50.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000938723  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22590  FHA domain-containing protein  36.36 
 
 
152 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.781297  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5356  FHA domain containing protein  36.36 
 
 
150 aa  50.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4329  FHA domain-containing protein  37.33 
 
 
228 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24475  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1632  FHA domain containing protein  37.21 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03330  FHA domain-containing protein  36.11 
 
 
138 aa  50.8  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0536542  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0909  FHA domain-containing protein  38.37 
 
 
120 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00800  FHA domain-containing protein  32.1 
 
 
186 aa  50.4  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.151264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1709  FHA domain-containing protein  34.94 
 
 
268 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2434  FHA domain containing protein  42.62 
 
 
178 aa  50.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00264365  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  40.79 
 
 
385 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2478  FHA domain containing protein  35.8 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3612  FHA domain containing protein  35.29 
 
 
514 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  hitchhiker  0.00187032 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1226  FHA domain-containing protein  42.62 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2308  FHA domain-containing protein  35.9 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0512464  hitchhiker  0.000482709 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15520  FHA domain-containing protein  36.25 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  36.11 
 
 
238 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0895  FHA domain containing protein  35.63 
 
 
122 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0092  FHA domain containing protein  34.62 
 
 
219 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2060  FHA domain-containing protein  32.63 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52887  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0899  FHA domain containing protein  35.63 
 
 
122 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1427  FHA domain containing protein  35.53 
 
 
245 aa  48.9  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0027  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
420 aa  48.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340956  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  37.33 
 
 
475 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00230  FHA domain-containing protein  32.5 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2967  winged helix family two component response transcriptional regulator  37.93 
 
 
218 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0849  FHA domain-containing protein  34.09 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0020  FHA domain-containing protein  32.5 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.844855  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>