275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5188 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_5188  FHA domain containing protein  100 
 
 
218 aa  436  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3940  FHA domain-containing protein  51.77 
 
 
225 aa  207  9e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4677  FHA domain-containing protein  51.54 
 
 
225 aa  194  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0067  hypothetical protein  47.09 
 
 
220 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0191  FHA domain-containing protein  48.07 
 
 
228 aa  184  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4680  FHA domain-containing protein  50.68 
 
 
219 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4043  FHA domain-containing protein  45.45 
 
 
211 aa  177  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3388  FHA domain containing protein  45.45 
 
 
211 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3949  FHA domain-containing protein  47.25 
 
 
188 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0228001 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2735  FHA domain-containing protein  44.8 
 
 
213 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.285351  normal  0.211409 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4783  FHA domain-containing protein  45.96 
 
 
236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0865  FHA domain-containing protein  44.35 
 
 
237 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.646672 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0921  FHA domain containing protein  35.32 
 
 
250 aa  138  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3359  forkhead-associated  36.75 
 
 
234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0494  FHA domain-containing protein  35.42 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0075919  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0951  FHA-domain containing protein  29.78 
 
 
269 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2548  FHA-domain containing protein  30.84 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0436  hypothetical protein  31.03 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0167824 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1054  FHA domain-containing protein  45.07 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000340466  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  36 
 
 
518 aa  64.7  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4329  FHA domain-containing protein  42.65 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24475  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  37 
 
 
513 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3491  FHA domain containing protein  40.79 
 
 
155 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1117  FHA domain-containing protein  35.48 
 
 
116 aa  62.8  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0556817  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0908  FHA domain-containing protein  36.26 
 
 
162 aa  62.4  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000938723  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  38.2 
 
 
630 aa  62  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1427  FHA domain containing protein  41.33 
 
 
245 aa  61.6  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4978  FHA domain-containing protein  39.24 
 
 
242 aa  61.6  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.064902  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2321  FHA domain-containing protein  38.64 
 
 
97 aa  61.6  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  41.89 
 
 
890 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3436  FHA domain-containing protein  28.46 
 
 
244 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  38.89 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  40.54 
 
 
515 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2061  FHA domain-containing protein  45.07 
 
 
242 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1710  FHA domain-containing protein  40 
 
 
168 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1378  hypothetical protein  38.54 
 
 
176 aa  59.3  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  33.91 
 
 
518 aa  58.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  40.51 
 
 
238 aa  58.9  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1693  FHA domain-containing protein  39.02 
 
 
167 aa  58.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514614  normal  0.923966 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1709  FHA domain-containing protein  38.75 
 
 
268 aa  58.2  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  40.54 
 
 
1004 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1780  FHA domain-containing protein  37.35 
 
 
154 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000257566  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1788  FHA domain containing protein  42.5 
 
 
153 aa  57  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0726  FHA domain containing protein  33.96 
 
 
198 aa  57.4  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.192616 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0330  FHA domain-containing protein  38.75 
 
 
144 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5356  FHA domain containing protein  40.51 
 
 
150 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0473  hypothetical protein  40.62 
 
 
147 aa  56.2  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.592992  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1632  FHA domain containing protein  37.8 
 
 
149 aa  55.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22590  FHA domain-containing protein  40.51 
 
 
152 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.781297  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1268  hypothetical protein  35.11 
 
 
270 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.331296  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2060  FHA domain-containing protein  37.35 
 
 
154 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52887  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3742  FHA domain-containing protein  40.51 
 
 
144 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2434  FHA domain containing protein  39.24 
 
 
178 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00264365  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2520  FHA domain-containing protein  39.51 
 
 
150 aa  55.5  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1823  FHA domain-containing protein  38.54 
 
 
863 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.997566  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27030  FHA domain-containing protein  41.46 
 
 
474 aa  55.1  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2382  forkhead-associated protein  39.51 
 
 
150 aa  55.1  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1395  forkhead-associated  40.26 
 
 
178 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0338  FHA domain-containing protein  38.75 
 
 
144 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4002  FHA domain-containing protein-like protein  35.71 
 
 
171 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759759  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4010  FHA domain containing protein  36.26 
 
 
156 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.196899  normal  0.106089 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2595  FHA domain containing protein  34.78 
 
 
272 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2967  winged helix family two component response transcriptional regulator  37.97 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0025  FHA domain-containing protein  36.25 
 
 
155 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1886  FHA domain containing protein  37.97 
 
 
156 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0328071 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2371  diguanylate cyclase  39.24 
 
 
294 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.191081 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1426  FHA domain containing protein  39.44 
 
 
145 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4979  FHA domain-containing protein  40.3 
 
 
158 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232716  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0798  FHA domain protein  39.58 
 
 
146 aa  53.1  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1342  FHA domain containing protein  38.46 
 
 
137 aa  53.1  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11857  hypothetical protein  38.37 
 
 
162 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.751406 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2688  FHA domain containing protein  33.71 
 
 
272 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00226297  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5478  FHA domain containing protein  34.31 
 
 
673 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366631  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2713  forkhead-associated protein  37.97 
 
 
176 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13440  FHA domain-containing protein  38.89 
 
 
149 aa  52.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1341  FHA domain containing protein  45.95 
 
 
374 aa  52.4  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287423 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03330  FHA domain-containing protein  41.43 
 
 
138 aa  52.4  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0536542  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3611  FHA domain containing protein  31.52 
 
 
279 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331547  hitchhiker  0.0013234 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  31.73 
 
 
1065 aa  52  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3658  winged helix family two component response transcriptional regulator  35.48 
 
 
220 aa  52  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  42.86 
 
 
385 aa  52  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18260  FHA domain-containing protein  36.71 
 
 
167 aa  51.6  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1470  FHA domain containing protein  40.26 
 
 
180 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3128  FHA domain containing protein  36.71 
 
 
179 aa  51.6  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0136  FHA domain containing protein  34.88 
 
 
177 aa  51.6  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.240573 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3613  FHA domain containing protein  36.36 
 
 
157 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140351  hitchhiker  0.00128978 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3060  FHA domain-containing protein  35.92 
 
 
253 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2844  FHA domain-containing protein  36.71 
 
 
158 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2888  FHA domain-containing protein  36.71 
 
 
158 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3045  FHA domain-containing protein  35.9 
 
 
174 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000453276  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2875  FHA domain-containing protein  36.71 
 
 
158 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3402  FHA domain-containing protein  36.71 
 
 
183 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10779  normal  0.511824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2726  FHA domain containing protein  38.96 
 
 
170 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800491  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3464  FHA domain containing protein  34.48 
 
 
694 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0731719  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  40 
 
 
910 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1542  FHA domain containing protein  37.78 
 
 
158 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3135  FHA domain-containing protein  36.71 
 
 
157 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547801  normal  0.0667215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2309  FHA domain-containing protein  35.44 
 
 
279 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0931454  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1309  FHA domain-containing protein  35.06 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0844943  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2992  diguanylate phosphodiesterase  32.93 
 
 
387 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>